70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  62.31 
 
 		 206 aa  233  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  64.18 
 
 		 209 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  54.95 
 
 		 227 aa  225  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  40.91 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  37.24 
 
 		 236 aa  128  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  41.04 
 
 		 222 aa  127  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  115  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  35.53 
 
 		 232 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  36.32 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  35.91 
 
 		 251 aa  112  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  37.04 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  34.98 
 
 		 225 aa  109  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  37.21 
 
 		 224 aa  105  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  35.61 
 
 		 256 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  33.66 
 
 		 243 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  33 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  36.32 
 
 		 301 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  35.79 
 
 		 304 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  37.3 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  34.31 
 
 		 327 aa  99  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  33.82 
 
 		 347 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  36.68 
 
 		 453 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  34.39 
 
 		 449 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  34.52 
 
 		 222 aa  95.9  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  34.74 
 
 		 273 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  34.74 
 
 		 273 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  34.74 
 
 		 273 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  34.01 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  36.32 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  34.67 
 
 		 532 aa  91.3  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  33.5 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  34.02 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  37.14 
 
 		 234 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  31.75 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  32.98 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  32.52 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  30.89 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  33.16 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  33.16 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  28.64 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  33.16 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  32.29 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  30.15 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  31.94 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  32.12 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  30.26 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  26.98 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  26.98 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  30.14 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  31.63 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  31.63 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  27.14 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  29.23 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  26.4 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  26.4 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  28.57 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  28.57 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  29.74 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  23.67 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  27.5 
 
 		 232 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  27.05 
 
 		 253 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  28.06 
 
 		 349 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  27.8 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  29.92 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1210  hypothetical protein  27.69 
 
 		 269 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.650687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  36.49 
 
 		 82 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  26.7 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2644  hypothetical protein  27.69 
 
 		 279 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  26.63 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>