88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2644 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2644  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  560  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1210  hypothetical protein  49.45 
 
 		 269 aa  251  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.650687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  42.72 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2326  hypothetical protein  36.13 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  31.34 
 
 		 340 aa  73.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  27.23 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  29.35 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  28.36 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  26.46 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  30.84 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  31.43 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  26.61 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  25.69 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  25.82 
 
 		 239 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  30.37 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  24.88 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  30.37 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  27.31 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  28.12 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  30.46 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  25.23 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  30.96 
 
 		 225 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  27.84 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  28 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  30.32 
 
 		 228 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  28.21 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  27.67 
 
 		 264 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  28.21 
 
 		 225 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  29.8 
 
 		 248 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  27.67 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  28.71 
 
 		 264 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  27.67 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  28.27 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  27.45 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  27.18 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  28.26 
 
 		 232 aa  50.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  29.29 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  26.7 
 
 		 264 aa  50.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  26.88 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  26.88 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3058  hypothetical protein  32.71 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  27.45 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  26.37 
 
 		 246 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  26.24 
 
 		 248 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  27.67 
 
 		 263 aa  49.7  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  27.89 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  26.19 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  25.12 
 
 		 232 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  28.36 
 
 		 238 aa  48.5  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  26.96 
 
 		 264 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  26.22 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  26.7 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  24.69 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  26.42 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  26.21 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  26.96 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  26.29 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  24.87 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  26.07 
 
 		 349 aa  46.6  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  26.29 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  25.51 
 
 		 229 aa  45.8  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  24.75 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  24.75 
 
 		 247 aa  45.8  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  28.82 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  35.29 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  26.11 
 
 		 338 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  25 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  25.24 
 
 		 262 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  23.08 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  25 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  24.24 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  24.88 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  29.65 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  27.59 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  23 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  27.69 
 
 		 202 aa  43.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  29.13 
 
 		 260 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  34.38 
 
 		 336 aa  42.7  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  28.92 
 
 		 263 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  23 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  28.92 
 
 		 260 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  25.55 
 
 		 270 aa  42.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>