66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2504 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  486  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  74.09 
 
 		 239 aa  347  1e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  51.69 
 
 		 232 aa  249  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  51.16 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  47.03 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  47.03 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  47.03 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  49.01 
 
 		 222 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  46.58 
 
 		 301 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  46.92 
 
 		 304 aa  189  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  46.73 
 
 		 223 aa  186  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  46.6 
 
 		 222 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  44.34 
 
 		 256 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  43.85 
 
 		 449 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  40.35 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  43.06 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  42.45 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  41.75 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  39.63 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  41.44 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  38.25 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  43.84 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  37.61 
 
 		 251 aa  145  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  37.09 
 
 		 532 aa  142  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  38.97 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  37.44 
 
 		 347 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  39.81 
 
 		 218 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  36.15 
 
 		 453 aa  132  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  35.75 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  37.98 
 
 		 230 aa  115  5e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  33.66 
 
 		 202 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  31.53 
 
 		 227 aa  98.6  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  34.78 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  29.44 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  28.36 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  30.77 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  28.44 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  25.51 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  27.55 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  25.59 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  27.86 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  27.04 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  26.79 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  27.89 
 
 		 221 aa  53.1  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  29.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  28.72 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  28.5 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  26.84 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  26.74 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2644  hypothetical protein  24.26 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  27.59 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  29.7 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  27.27 
 
 		 264 aa  45.4  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  27.64 
 
 		 269 aa  45.4  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  29.8 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  36.49 
 
 		 82 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  27.14 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  27.95 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  26.88 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  25.87 
 
 		 349 aa  43.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  26.88 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  26.98 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  23.14 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4512  protein of unknown function DUF124  24.29 
 
 		 533 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  22.62 
 
 		 230 aa  42  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  25.67 
 
 		 316 aa  41.6  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>