59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3945 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  100 
 
 
273 aa  551  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  99.63 
 
 
273 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  79.64 
 
 
304 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  78.16 
 
 
301 aa  456  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  61 
 
 
220 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  59.7 
 
 
222 aa  238  9e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  55.56 
 
 
222 aa  234  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  55.94 
 
 
219 aa  225  6e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  50.48 
 
 
232 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  53.23 
 
 
256 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  48.4 
 
 
225 aa  206  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  51.28 
 
 
223 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  50.51 
 
 
236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  47.03 
 
 
243 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  48.86 
 
 
449 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  47.06 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  47.55 
 
 
225 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  44.95 
 
 
239 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  41.18 
 
 
231 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  41.33 
 
 
532 aa  153  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  47.09 
 
 
327 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  40.61 
 
 
251 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  42.64 
 
 
230 aa  146  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  39.29 
 
 
453 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  41.62 
 
 
229 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  45.37 
 
 
347 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  39.7 
 
 
218 aa  130  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 
218 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  35.96 
 
 
221 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  34.95 
 
 
216 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  32.99 
 
 
227 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  34.74 
 
 
202 aa  95.5  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  37.37 
 
 
209 aa  93.2  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  30.39 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  31.25 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  31.31 
 
 
247 aa  72  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  32.06 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  30.29 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  30.62 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  28.24 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  30.43 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  43.84 
 
 
82 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  27.84 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3569  hypothetical protein  28.41 
 
 
177 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  31.01 
 
 
238 aa  47  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  24.12 
 
 
250 aa  47  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  30.71 
 
 
225 aa  45.8  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  24.62 
 
 
250 aa  45.4  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  23.23 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  27.81 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  35.62 
 
 
222 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  28.21 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  27.46 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  32.12 
 
 
247 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  32.12 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  32.12 
 
 
247 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  28.72 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  32.42 
 
 
246 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>