68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4073 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  70.64 
 
 
219 aa  319  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  61.01 
 
 
256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  61.54 
 
 
222 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  61.09 
 
 
222 aa  260  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  61.5 
 
 
273 aa  241  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  61 
 
 
273 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  61 
 
 
273 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  58.88 
 
 
304 aa  234  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  59.39 
 
 
301 aa  234  8e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  52.97 
 
 
449 aa  226  3e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  52.34 
 
 
236 aa  214  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  49.78 
 
 
225 aa  210  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  49.78 
 
 
232 aa  207  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  47.91 
 
 
223 aa  194  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  42.08 
 
 
231 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  41.67 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  44.39 
 
 
327 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  46.7 
 
 
225 aa  161  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  41.75 
 
 
243 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  44.22 
 
 
225 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  44.39 
 
 
230 aa  158  8e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  43.88 
 
 
229 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  43.5 
 
 
347 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  41.82 
 
 
251 aa  154  8e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  43 
 
 
532 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  42 
 
 
453 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  39.9 
 
 
218 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  38.39 
 
 
218 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  38 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  35.38 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  36.32 
 
 
202 aa  113  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  37.07 
 
 
209 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  34.33 
 
 
227 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  31.22 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  34.95 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  32.84 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  30.59 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  29.41 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  30.84 
 
 
234 aa  69.7  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  31.1 
 
 
257 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  30.24 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  28.78 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  31.69 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  31.69 
 
 
247 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  29.53 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  31.16 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  29.13 
 
 
218 aa  51.6  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  30.98 
 
 
247 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  26.88 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  26.28 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  31.15 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  37.33 
 
 
82 aa  50.1  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  33.09 
 
 
238 aa  49.3  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  29.85 
 
 
235 aa  48.9  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  26.61 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  36.59 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  27.94 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  23 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  28.7 
 
 
225 aa  43.5  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  29.06 
 
 
259 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  27.97 
 
 
231 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  27.5 
 
 
232 aa  43.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  28.7 
 
 
225 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  23 
 
 
250 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  26.19 
 
 
349 aa  42  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  28.57 
 
 
229 aa  42  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  34.57 
 
 
225 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>