117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4143 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  100 
 
 		 226 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  56.89 
 
 		 225 aa  267  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  54.02 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  51.34 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  51.56 
 
 		 228 aa  237  9e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  42.22 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  45.33 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  41.07 
 
 		 224 aa  167  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  37.78 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  37.91 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  37.05 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  37.05 
 
 		 225 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  39.11 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  37.61 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  39.56 
 
 		 235 aa  148  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  34.82 
 
 		 224 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  35.71 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0439  protein of unknown function DUF124  37.09 
 
 		 202 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  30.36 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  33.64 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  33.33 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  30.67 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  33.48 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  29.2 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  30.4 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  29.2 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  30.4 
 
 		 220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  35.09 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  35.09 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  29.2 
 
 		 232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  29.41 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  32.77 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  29.02 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  28.44 
 
 		 349 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  31.28 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  31.98 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  33.03 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  32.27 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02993  DUF124 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08610)  29.11 
 
 		 373 aa  91.3  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  31.73 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  30.19 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  31.66 
 
 		 340 aa  86.7  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  28.77 
 
 		 232 aa  86.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34460  hypothetical protein  31.51 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.727592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  30.09 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  32.54 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  27.7 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  31.19 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  32 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  28.3 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  29.67 
 
 		 272 aa  72  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  31.4 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  31.4 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  29.08 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  27.88 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  28.78 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  29.08 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  31.1 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  31.25 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  29.08 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  29.05 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  28.64 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  27.54 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  26.11 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  28.28 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  29.03 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  29.58 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  28.99 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  26.98 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  28.3 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  29.05 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  27.35 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  27.78 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  26.57 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  24.76 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  30.36 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  27.18 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  25.84 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  27.05 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  25.35 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  25.35 
 
 		 263 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  25.35 
 
 		 260 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  26.09 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  24.76 
 
 		 267 aa  52  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  25.47 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  27.23 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  26.57 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1210  hypothetical protein  25.4 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.650687  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  26.57 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  27.1 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  25.96 
 
 		 253 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  27.38 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  27.38 
 
 		 226 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  26.02 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>