115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0457 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  51.36 
 
 
233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  52.73 
 
 
220 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  52.73 
 
 
220 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  37.38 
 
 
224 aa  141  9e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  33.03 
 
 
231 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  34.08 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  30.7 
 
 
349 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  32.31 
 
 
227 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  33.18 
 
 
247 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  34.55 
 
 
246 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  33.18 
 
 
247 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  33.18 
 
 
247 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  32.14 
 
 
232 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  32.14 
 
 
232 aa  123  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  32.88 
 
 
225 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  31.82 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  33.48 
 
 
235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  33.02 
 
 
221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  32.13 
 
 
225 aa  112  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  34.63 
 
 
225 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  34.63 
 
 
225 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  31.8 
 
 
223 aa  111  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  29.41 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  30.28 
 
 
225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  32.88 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  31.75 
 
 
226 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  30.28 
 
 
225 aa  108  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  32.91 
 
 
248 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  31.82 
 
 
227 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  32.46 
 
 
272 aa  106  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  31.58 
 
 
270 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  30.14 
 
 
224 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  33.95 
 
 
222 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  32.43 
 
 
275 aa  102  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  33.18 
 
 
233 aa  102  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  32.6 
 
 
242 aa  101  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  32.14 
 
 
263 aa  101  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  31.96 
 
 
264 aa  101  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  29.68 
 
 
264 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  33.02 
 
 
222 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  32.03 
 
 
327 aa  99.4  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  30.04 
 
 
261 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  33.18 
 
 
266 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  30.77 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  30.18 
 
 
229 aa  99.4  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  97.4  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  28.31 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  30.36 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  32.09 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  32.44 
 
 
248 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  31.63 
 
 
262 aa  96.3  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  30.22 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  31.14 
 
 
267 aa  95.9  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  30.77 
 
 
338 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  29.68 
 
 
264 aa  95.5  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  29.68 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  29.22 
 
 
264 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  29.68 
 
 
264 aa  94.7  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  29.31 
 
 
259 aa  94  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  29.68 
 
 
264 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  29.68 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  29.22 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  29.22 
 
 
264 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  29.22 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  29.3 
 
 
240 aa  94  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  29.91 
 
 
262 aa  92.8  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  31.51 
 
 
259 aa  91.7  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  32.74 
 
 
224 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  25.46 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  24.54 
 
 
250 aa  90.1  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  29.38 
 
 
251 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  25.23 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  29.49 
 
 
336 aa  89  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  30.88 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  30.77 
 
 
267 aa  88.2  8e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  30 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  28.45 
 
 
259 aa  86.3  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  29.15 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  28.25 
 
 
256 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  29.82 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  29.15 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  29.36 
 
 
319 aa  82  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  27.16 
 
 
260 aa  82  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  27.35 
 
 
263 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  27.47 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  27.35 
 
 
260 aa  82  0.000000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  30.45 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  30.17 
 
 
244 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  28.18 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  30.57 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  26.32 
 
 
232 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  26.51 
 
 
316 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>