116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1587 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  100 
 
 		 254 aa  495  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  43.56 
 
 		 316 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  43.91 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  42.17 
 
 		 253 aa  175  8e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  41.94 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  40.44 
 
 		 340 aa  174  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  37.94 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  42.53 
 
 		 319 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 		 229 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  36.44 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  37.16 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  37.89 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  35.68 
 
 		 225 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  36.61 
 
 		 270 aa  141  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  40.79 
 
 		 338 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  37.01 
 
 		 327 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  37.95 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  35.96 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  34.5 
 
 		 261 aa  134  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  33.74 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  36.15 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  32.61 
 
 		 262 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  34.36 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 224 aa  132  7.999999999999999e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  35.68 
 
 		 263 aa  131  7.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  36.44 
 
 		 275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  35.96 
 
 		 244 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  36.77 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  36.44 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  32.79 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  35.87 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  32.24 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  36.73 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  36.28 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  35.68 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  36.22 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  36.09 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  35.59 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  31.22 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  33.06 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  36 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  35.56 
 
 		 248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  33.47 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  33.64 
 
 		 218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  34.07 
 
 		 248 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  33.48 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  32.66 
 
 		 264 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  33.87 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  32.61 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  32.61 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  34.27 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  33.06 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  34.27 
 
 		 264 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  33.87 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  32.66 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  32.66 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  32.23 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  32.66 
 
 		 264 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  32.26 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  32.26 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  30.33 
 
 		 264 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  31.7 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  36.36 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  36.36 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  32.59 
 
 		 230 aa  97.8  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  29.03 
 
 		 223 aa  95.9  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  33.18 
 
 		 246 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  30.94 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  30.49 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  30.49 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  29.25 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  28.05 
 
 		 231 aa  92  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  28.11 
 
 		 224 aa  85.5  7e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  27.09 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  28.31 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  27.07 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  26.11 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  32.86 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45624  predicted protein  27.78 
 
 		 298 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322694  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  27.57 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  27.06 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  29.41 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  29.21 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  25 
 
 		 243 aa  69.3  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02993  DUF124 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08610)  27.12 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  27.96 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  31.93 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  27.49 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  28.22 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  28.39 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  26.87 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  24.24 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  24.24 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  31.46 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  26.37 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>