134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0344 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  81.17 
 
 
228 aa  391  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  41.67 
 
 
231 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  41.52 
 
 
246 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  38.6 
 
 
247 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  39.29 
 
 
247 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  39.29 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  37.78 
 
 
226 aa  159  5e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  36.99 
 
 
227 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  37.17 
 
 
231 aa  152  5e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  35.37 
 
 
228 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  37.95 
 
 
225 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  36.7 
 
 
225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  35.11 
 
 
232 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  35.11 
 
 
232 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  39.29 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  38.57 
 
 
225 aa  144  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  38.84 
 
 
235 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  38.12 
 
 
225 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  37.56 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  36.24 
 
 
228 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  37.78 
 
 
223 aa  137  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  32.6 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  33.64 
 
 
250 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  34.38 
 
 
224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  33.18 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  33.91 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  34.47 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  33.63 
 
 
250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  35.59 
 
 
221 aa  123  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02993  DUF124 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08610)  33.8 
 
 
373 aa  121  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29967  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  34.72 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  34.72 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  34.25 
 
 
259 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  31.6 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  33.78 
 
 
240 aa  115  5e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  33.8 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  31.63 
 
 
230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  35.29 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  35.29 
 
 
220 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  35.4 
 
 
233 aa  113  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  36.87 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  31.16 
 
 
232 aa  111  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  35.48 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  34.1 
 
 
222 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  31.82 
 
 
220 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  31.47 
 
 
238 aa  102  4e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  30.66 
 
 
316 aa  101  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  36.07 
 
 
244 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  33.64 
 
 
291 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  35.1 
 
 
263 aa  99.4  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  29.05 
 
 
340 aa  94.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  32.7 
 
 
338 aa  93.2  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  31.1 
 
 
270 aa  92.8  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  33.33 
 
 
259 aa  92  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  31.28 
 
 
234 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  30.48 
 
 
272 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  32.14 
 
 
262 aa  89  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  33.01 
 
 
256 aa  88.6  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  34.65 
 
 
224 aa  87  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  34.4 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  36.18 
 
 
269 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  29.52 
 
 
267 aa  85.1  8e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  33.18 
 
 
277 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  29.17 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  30.53 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  32.06 
 
 
327 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  33.33 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  33.96 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  32.71 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  30.66 
 
 
266 aa  81.6  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  34.23 
 
 
264 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  31.08 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  31.02 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  31.08 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  27.52 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  31.08 
 
 
260 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  31.02 
 
 
260 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  30.37 
 
 
336 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  30.56 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  30.09 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  30.56 
 
 
260 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  29.15 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  32.75 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  33.78 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  33.78 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  28.71 
 
 
267 aa  72.8  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  29.15 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  23.44 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  33.33 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  32.3 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  31.31 
 
 
264 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0439  protein of unknown function DUF124  29.29 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  30.29 
 
 
242 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  24.14 
 
 
218 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  32.85 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  31.46 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  32.71 
 
 
264 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  29.61 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  31.48 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>