131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4068 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  96.05 
 
 		 253 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  95.45 
 
 		 269 aa  447  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  95.4 
 
 		 319 aa  443  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  72.02 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  67.47 
 
 		 340 aa  352  2e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  50.44 
 
 		 228 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  52.47 
 
 		 229 aa  218  6e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  50.43 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  49.13 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  48.07 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  49.57 
 
 		 267 aa  206  4e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  46.86 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  50.43 
 
 		 234 aa  201  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  48.05 
 
 		 267 aa  197  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  45.71 
 
 		 338 aa  195  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  44.4 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  44.4 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  49.78 
 
 		 224 aa  193  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  47.39 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  45.61 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  47.39 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  49.32 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  44.74 
 
 		 277 aa  185  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  44.74 
 
 		 275 aa  184  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  44.72 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  43.23 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  49.14 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  48.71 
 
 		 265 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  45.61 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  45.02 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  41.63 
 
 		 336 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  40.54 
 
 		 225 aa  178  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  40.62 
 
 		 225 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  48.29 
 
 		 242 aa  175  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  46.49 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  45.99 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  46.26 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  46.05 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  47.39 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  44.1 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  47.58 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  46.26 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  46.26 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  43.04 
 
 		 233 aa  166  5e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  46.26 
 
 		 260 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  46.26 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  45.92 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  45.92 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  39.09 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  45.92 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  42.55 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  45.45 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  44.21 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  42.44 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  43.04 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  42.56 
 
 		 264 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  42.44 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  42.44 
 
 		 264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  38.7 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  42.44 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  41.6 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  42.02 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  41.6 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  41.6 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  41.63 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  36.94 
 
 		 232 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  35.14 
 
 		 230 aa  145  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  36.19 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  48.04 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  48.04 
 
 		 226 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  37.77 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  35.11 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  34.8 
 
 		 305 aa  122  5e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  32.9 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  32.9 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  32.9 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  33.49 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  38.14 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  35.05 
 
 		 231 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  34.76 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  34.39 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  36.16 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  31.98 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  31.98 
 
 		 232 aa  108  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  34.76 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  34.03 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  36.04 
 
 		 225 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  31.53 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  34.4 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  30.43 
 
 		 223 aa  99.4  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  31.4 
 
 		 221 aa  99.4  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  31.63 
 
 		 228 aa  99  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  31.33 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  31.14 
 
 		 220 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  31.14 
 
 		 220 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  32.67 
 
 		 349 aa  95.5  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  30.97 
 
 		 259 aa  95.1  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45624  predicted protein  31.23 
 
 		 298 aa  92.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322694  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  28.77 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>