44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0439 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0439  protein of unknown function DUF124  100 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  49.29 
 
 		 225 aa  204  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34460  hypothetical protein  50.3 
 
 		 174 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.727592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  40.28 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  37.09 
 
 		 226 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  37.56 
 
 		 228 aa  129  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  34.43 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  29.91 
 
 		 231 aa  90.5  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  31 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  25.48 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  27.4 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  30.62 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  30.2 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  31.31 
 
 		 228 aa  72  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  25.7 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  23.92 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  29.29 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  24.29 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  29.85 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  29.85 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  23.92 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  23.92 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  27.94 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  26.19 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  29.85 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  23.47 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  23.47 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  28.5 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  21.5 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  21.13 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  24.37 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  27.05 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  27.59 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  25.87 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  27.59 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  27.27 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02993  DUF124 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08610)  27.72 
 
 		 373 aa  53.9  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  28 
 
 		 250 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  27.04 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  30.07 
 
 		 229 aa  44.7  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  27.18 
 
 		 218 aa  44.7  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  24.35 
 
 		 232 aa  41.6  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>