49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34460 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34460  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  345  2e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.727592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0439  protein of unknown function DUF124  50.3 
 
 		 202 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34470  conserved hypothetical protein TIGR00266  42.07 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.911046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  37.93 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5374  protein of unknown function DUF124  29.89 
 
 		 228 aa  88.2  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5534  hypothetical protein  34.25 
 
 		 228 aa  87.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.789066  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  32.12 
 
 		 231 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4143  protein of unknown function DUF124  31.51 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  34.33 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  33.58 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  32.84 
 
 		 225 aa  67.8  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  30.15 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  31.76 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  26.57 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  36 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  36 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  36 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02993  DUF124 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G08610)  28.66 
 
 		 373 aa  58.5  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  27.78 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  25.31 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  25.31 
 
 		 232 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  25.79 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  23.31 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  26.88 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  28.36 
 
 		 228 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  27.21 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  25.16 
 
 		 223 aa  52.4  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  26.74 
 
 		 235 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  25 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  25 
 
 		 225 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  30.82 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  23.36 
 
 		 267 aa  45.8  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  22.88 
 
 		 232 aa  45.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  23.13 
 
 		 349 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  24.07 
 
 		 259 aa  44.3  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  26.9 
 
 		 340 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  29.92 
 
 		 263 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  28.47 
 
 		 221 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  26.25 
 
 		 229 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  25.15 
 
 		 272 aa  42.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  26.21 
 
 		 316 aa  42.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  24.68 
 
 		 261 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  27.15 
 
 		 338 aa  41.6  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  23.08 
 
 		 238 aa  40.8  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  25.55 
 
 		 270 aa  40.8  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  24.38 
 
 		 232 aa  40.8  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>