31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1838 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
257 aa  525  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  66.27 
 
 
247 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  59.11 
 
 
253 aa  291  9e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  59.5 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  31.58 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  32.06 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  32.06 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  31.1 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  30.81 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  31.58 
 
 
273 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  31.53 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  31.82 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  30.6 
 
 
222 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  29.3 
 
 
221 aa  63.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  30.04 
 
 
225 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  27.86 
 
 
243 aa  59.3  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  28.32 
 
 
449 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  30.36 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  30.14 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  27.06 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  26 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  28.5 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  28.45 
 
 
222 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  30.43 
 
 
223 aa  53.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  26.29 
 
 
218 aa  52.8  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  25.37 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  27.67 
 
 
216 aa  45.4  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  30.26 
 
 
347 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  28.04 
 
 
236 aa  43.5  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  25.24 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  31.52 
 
 
224 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>