56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  444  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  52.68 
 
 		 222 aa  211  7.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  50.92 
 
 		 216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  45.89 
 
 		 234 aa  151  8e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  42.13 
 
 		 227 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  38.14 
 
 		 202 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  37.78 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  34.08 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  31.73 
 
 		 449 aa  90.5  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  27.68 
 
 		 231 aa  88.6  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  30.91 
 
 		 251 aa  88.2  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  34.42 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  29.68 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  30.59 
 
 		 220 aa  84.7  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  31.51 
 
 		 222 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  33.02 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  29.95 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  31.98 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  32.02 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  30.28 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  32.88 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  30.14 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  31.82 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  29.41 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  29.33 
 
 		 327 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  28.51 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  29.63 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  29.63 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  30.18 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  28.44 
 
 		 347 aa  71.6  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  29.65 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  29.95 
 
 		 453 aa  71.6  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  28.7 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  29.17 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  28.7 
 
 		 301 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  29.09 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  27.98 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  26.57 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  31.65 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  26.15 
 
 		 227 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  25.35 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  25.82 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  31.31 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  31.72 
 
 		 253 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  30.17 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  23.83 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  27.31 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  28.65 
 
 		 227 aa  45.8  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  27.43 
 
 		 349 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  29.07 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  28.5 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  23.7 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  28.5 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  29.28 
 
 		 257 aa  42.4  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  28.5 
 
 		 247 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  29.63 
 
 		 246 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>