47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2433 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  85.71 
 
 
230 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  45.45 
 
 
256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  45.41 
 
 
220 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  47.92 
 
 
219 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  46.31 
 
 
222 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  45.81 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  43.65 
 
 
301 aa  160  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  43 
 
 
304 aa  159  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  42.64 
 
 
273 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  42.13 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  42.13 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  42.06 
 
 
236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  40 
 
 
232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  42.03 
 
 
231 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  40.39 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  39.11 
 
 
449 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  38.07 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  35.75 
 
 
243 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  36.89 
 
 
218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  37.33 
 
 
251 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  35.55 
 
 
239 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  40.7 
 
 
218 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  38 
 
 
532 aa  122  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  38.65 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  37.56 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  36.5 
 
 
453 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  36.14 
 
 
225 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  36.22 
 
 
216 aa  101  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  32.42 
 
 
347 aa  99  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  38.27 
 
 
209 aa  98.6  8e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  35.32 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  33.64 
 
 
327 aa  98.6  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  34.02 
 
 
202 aa  94.4  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  29.74 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  31.53 
 
 
222 aa  70.1  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  28.64 
 
 
224 aa  69.3  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  30.09 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  26.13 
 
 
247 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  24.74 
 
 
253 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  28.85 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  24.62 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  26.83 
 
 
257 aa  45.8  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2644  hypothetical protein  29.46 
 
 
279 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  28.33 
 
 
349 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3630  protein of unknown function DUF124  25.93 
 
 
428 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3704  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.93 
 
 
426 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>