59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1839 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  100 
 
 
222 aa  431  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  52.73 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  54.17 
 
 
224 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  49.15 
 
 
234 aa  169  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  39.07 
 
 
227 aa  135  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  41.98 
 
 
202 aa  134  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  39.19 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  33.64 
 
 
206 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  32.06 
 
 
231 aa  103  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  33.03 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  34.26 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  33.64 
 
 
225 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  30.54 
 
 
449 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  33.17 
 
 
236 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  30.77 
 
 
304 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  33 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  30.77 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  32.51 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  32.34 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  31.6 
 
 
225 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  33 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  34.65 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  31.9 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  32.84 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  30.29 
 
 
532 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  29.35 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  30.14 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  31.37 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  30.05 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  28.86 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  29.61 
 
 
347 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  29.65 
 
 
453 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  29.13 
 
 
327 aa  61.6  0.000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  28.31 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  21.7 
 
 
224 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  27.19 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  26.34 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  28.5 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  27.44 
 
 
228 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  25.74 
 
 
225 aa  49.3  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  25.74 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  26.73 
 
 
227 aa  48.1  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  29.66 
 
 
238 aa  48.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  30.73 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  25 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  25.79 
 
 
327 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  26.29 
 
 
247 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  25 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  27.23 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  27.23 
 
 
247 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  23.47 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  26.89 
 
 
247 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  30.28 
 
 
248 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  28.99 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  24.02 
 
 
263 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  25 
 
 
259 aa  42  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>