82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1840 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  100 
 
 		 209 aa  414  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  64.18 
 
 		 202 aa  252  3e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  64.4 
 
 		 206 aa  226  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  54.11 
 
 		 227 aa  204  7e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  42.42 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  36.41 
 
 		 251 aa  125  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  39.64 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  35.41 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  35.44 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  39.23 
 
 		 256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  37.75 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  37.07 
 
 		 220 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  34.8 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  34.8 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  36.76 
 
 		 219 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  42.44 
 
 		 230 aa  107  9.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  37.78 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  35.45 
 
 		 449 aa  105  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  39.29 
 
 		 229 aa  103  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  37.44 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  35.27 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  36.79 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  37.89 
 
 		 273 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  37.37 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  37.37 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  37.37 
 
 		 301 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  36.84 
 
 		 304 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  35.64 
 
 		 239 aa  97.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  36.44 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  35.78 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  32.21 
 
 		 347 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  35.98 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  36.13 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  31.25 
 
 		 327 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  33.66 
 
 		 222 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  32.06 
 
 		 532 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  32.54 
 
 		 453 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  32.23 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  27.09 
 
 		 224 aa  61.2  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  29.8 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  29.29 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  26.94 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  28.07 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  25.49 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  28.42 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  32.28 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  31.09 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  30.57 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  30.57 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  31.13 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  31.13 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  27.49 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  28.02 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  28.02 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  32.54 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  27.45 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  25.13 
 
 		 349 aa  48.9  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  27.67 
 
 		 253 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3326  protein of unknown function DUF124  29.27 
 
 		 225 aa  48.1  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561063  normal  0.199232 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  26.11 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  26.11 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0505  hypothetical protein  25.77 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.375429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  29.19 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1210  hypothetical protein  25.74 
 
 		 269 aa  45.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.650687  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  27.57 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0067  protein of unknown function DUF124  25.58 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.226937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  26.87 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0069  protein of unknown function DUF124  25.58 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  28.43 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  27.78 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  25.85 
 
 		 340 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  26.21 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  41.82 
 
 		 82 aa  43.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  24.76 
 
 		 231 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  27.68 
 
 		 260 aa  42.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  27.68 
 
 		 263 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  27.68 
 
 		 260 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  27.23 
 
 		 260 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73040  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.37 
 
 		 397 aa  42  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.487189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  31.25 
 
 		 253 aa  42  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  28.22 
 
 		 228 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>