35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22620 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22620  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  521  1e-147  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2644  hypothetical protein  42.72 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1210  hypothetical protein  40.72 
 
 
269 aa  157  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.650687  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2326  hypothetical protein  33.82 
 
 
264 aa  116  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  29.9 
 
 
221 aa  58.9  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  32.39 
 
 
228 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0078  hypothetical protein  27.23 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113139  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  26.42 
 
 
222 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  27.69 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  27.41 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  27.51 
 
 
340 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  28.22 
 
 
251 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  27.05 
 
 
202 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  28.49 
 
 
224 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  25.85 
 
 
231 aa  47  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0762  hypothetical protein  23.53 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00396139  normal  0.18446 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0068  protein of unknown function DUF124  35.8 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.773898 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0070  protein of unknown function DUF124  35.8 
 
 
225 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0768  hypothetical protein  23.53 
 
 
250 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.404092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  25.36 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3058  hypothetical protein  26.19 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  28.17 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  24.76 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0506  hypothetical protein  33.33 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  27.43 
 
 
232 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  27.59 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  26.87 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  28.21 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  28.21 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  28.21 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  23.14 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  24.66 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  28.72 
 
 
225 aa  42.7  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  30.16 
 
 
256 aa  42  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>