29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04170 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  56.96 
 
 
231 aa  94.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  53.66 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  41.1 
 
 
223 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  43.84 
 
 
225 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  42.47 
 
 
236 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  46.25 
 
 
221 aa  58.9  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  45.21 
 
 
301 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  43.84 
 
 
304 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  43.84 
 
 
273 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  43.84 
 
 
273 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  43.84 
 
 
273 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  44 
 
 
449 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  42.67 
 
 
218 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  43.24 
 
 
227 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  38.67 
 
 
218 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  34.25 
 
 
232 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  37.33 
 
 
220 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  37.84 
 
 
225 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  38.36 
 
 
219 aa  47.4  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  38.96 
 
 
239 aa  46.6  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  36.49 
 
 
225 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  35.62 
 
 
222 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  36.49 
 
 
243 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  36.49 
 
 
202 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  34.25 
 
 
222 aa  43.5  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  41.82 
 
 
209 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  36.49 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  32.43 
 
 
216 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>