66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24890 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  71.74 
 
 
243 aa  348  6e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  48.89 
 
 
232 aa  228  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  47.44 
 
 
236 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  49 
 
 
222 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  44.24 
 
 
223 aa  184  9e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  44.75 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  45.73 
 
 
304 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  45.37 
 
 
222 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  44.95 
 
 
273 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  42.47 
 
 
449 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  44.95 
 
 
273 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  44.95 
 
 
273 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  45.45 
 
 
301 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  43.86 
 
 
225 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  40 
 
 
231 aa  165  5e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  41.67 
 
 
220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  42.2 
 
 
219 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  41.28 
 
 
225 aa  156  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  40.35 
 
 
251 aa  155  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  40 
 
 
225 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  42.18 
 
 
221 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  38.76 
 
 
218 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  38.32 
 
 
532 aa  136  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  39.61 
 
 
218 aa  135  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  38.67 
 
 
347 aa  135  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  37.84 
 
 
327 aa  134  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  37.38 
 
 
453 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  38.65 
 
 
230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  34.1 
 
 
229 aa  115  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  33.17 
 
 
227 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  33 
 
 
202 aa  100  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1840  protein of unknown function DUF124  35.64 
 
 
209 aa  86.7  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4759  protein of unknown function DUF124  29.13 
 
 
206 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.581241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  31.98 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  28.37 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  30.14 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  27.55 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2644  hypothetical protein  25.82 
 
 
279 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  26.47 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  26 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  28.72 
 
 
340 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  25.62 
 
 
222 aa  52  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  25.12 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  25.62 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  27.23 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  27.69 
 
 
225 aa  48.5  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  25.93 
 
 
221 aa  48.5  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  27.69 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1210  hypothetical protein  21.89 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.650687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04170  hypothetical protein  38.96 
 
 
82 aa  46.6  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  27.14 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  26.6 
 
 
319 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  25.41 
 
 
224 aa  45.4  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  26.34 
 
 
228 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  27.69 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1500  hypothetical protein  28.57 
 
 
231 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0203519  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  26.63 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3685  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
495 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  22.88 
 
 
259 aa  43.5  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  26.51 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  26.51 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3621  protein of unknown function DUF124  26.04 
 
 
232 aa  42.4  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002888  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  25.75 
 
 
234 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  26.17 
 
 
246 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>