39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_35210  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  502  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1838  protein of unknown function DUF124  66.95 
 
 		 257 aa  326  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4757  protein of unknown function DUF124  62.2 
 
 		 253 aa  324  7e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2237  protein of unknown function DUF124  59.11 
 
 		 249 aa  302  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000136487  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2247  hypothetical protein  30.81 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.151804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3959  hypothetical protein  31.31 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0146927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3945  hypothetical protein  31.31 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4019  hypothetical protein  31.31 
 
 		 273 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3123  protein of unknown function DUF124  30.1 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0308  hypothetical protein  27.09 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4445  hypothetical protein  30.29 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4073  protein of unknown function DUF124  30.24 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4681  protein of unknown function DUF124  29.17 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0576397  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2903  hypothetical protein  28.76 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.1717  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1748  protein of unknown function DUF124  28.23 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1635  protein of unknown function DUF124  27.75 
 
 		 218 aa  62  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.175019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2310  hypothetical protein  30.14 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0236  hypothetical protein  28.37 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.761624  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0789  protein of unknown function DUF124  29.53 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2504  hypothetical protein  25.59 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00378387  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3200  hypothetical protein  28.43 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24890  hypothetical protein  25 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4269  protein of unknown function DUF124  26.47 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0370045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35200  hypothetical protein  31.19 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2235  protein of unknown function DUF124  26.19 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00213908  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2236  protein of unknown function DUF124  26.89 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000939724  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1629  hypothetical protein  28.44 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.630619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3674  protein of unknown function DUF124  29.38 
 
 		 222 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07530  hypothetical protein  27.23 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.681488  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2433  hypothetical protein  26.63 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227247  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4758  protein of unknown function DUF124  26.47 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.386135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  30 
 
 		 449 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2449  protein of unknown function DUF124  28.95 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2819  hypothetical protein  26.19 
 
 		 230 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  27.65 
 
 		 227 aa  49.3  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2311  hypothetical protein  26.04 
 
 		 347 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.1559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2902  hypothetical protein  26.7 
 
 		 327 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0353217  normal  0.31292 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35190  hypothetical protein  27.8 
 
 		 202 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1839  protein of unknown function DUF124  26.76 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>