135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0946 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0946  tellurium resistance protein, putative  100 
 
 
412 aa  847    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2136  stress protein  50.93 
 
 
431 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.312276  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  42.55 
 
 
427 aa  358  7e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  31.67 
 
 
437 aa  215  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  33.01 
 
 
413 aa  207  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  46.96 
 
 
453 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  43.93 
 
 
532 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  46.38 
 
 
404 aa  120  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5506  hypothetical protein  29.25 
 
 
248 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491224  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  29.24 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  25.89 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  25.89 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  25.89 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  30.19 
 
 
493 aa  77.4  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  29.83 
 
 
449 aa  77  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  27.88 
 
 
432 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  27.81 
 
 
385 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  30.06 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  30 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  30.28 
 
 
419 aa  70.5  0.00000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  29.48 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  30 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  30 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  28.95 
 
 
428 aa  68.9  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  30 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  30 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  30 
 
 
192 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  31.69 
 
 
611 aa  68.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  29.95 
 
 
370 aa  68.9  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  25.44 
 
 
384 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  27.45 
 
 
402 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  27.45 
 
 
401 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  29.47 
 
 
192 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  29.47 
 
 
192 aa  67  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  28.95 
 
 
192 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  29.58 
 
 
289 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  31.54 
 
 
194 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  32.72 
 
 
427 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  30.2 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  29.53 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  29.53 
 
 
191 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  32.02 
 
 
401 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  29.53 
 
 
191 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  30.87 
 
 
194 aa  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  29.38 
 
 
194 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  29.38 
 
 
194 aa  63.5  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  26.26 
 
 
401 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  29.73 
 
 
192 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  30.2 
 
 
196 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  30.2 
 
 
196 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  30.2 
 
 
196 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  30.2 
 
 
194 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  29.41 
 
 
248 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  25.67 
 
 
189 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  30.2 
 
 
194 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  30.46 
 
 
192 aa  62  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  29.01 
 
 
200 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  28.18 
 
 
412 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  27.43 
 
 
722 aa  62.4  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  29.53 
 
 
191 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.71 
 
 
590 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  29.19 
 
 
675 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  29.53 
 
 
194 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  29.53 
 
 
194 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  30.87 
 
 
191 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  30.14 
 
 
192 aa  60.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  29.53 
 
 
194 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  29.53 
 
 
194 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  29.14 
 
 
191 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  30.2 
 
 
191 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  28.38 
 
 
190 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  26.42 
 
 
192 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  30.28 
 
 
191 aa  59.7  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3376  hypothetical protein  35.21 
 
 
259 aa  59.7  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.286986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  27.52 
 
 
191 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  30.2 
 
 
191 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  29.03 
 
 
192 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  26.42 
 
 
192 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3023  stress protein  28.47 
 
 
188 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102186  hitchhiker  0.000574983 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  30 
 
 
191 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  27.52 
 
 
191 aa  58.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  28.86 
 
 
191 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  28.19 
 
 
192 aa  57.8  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  27.1 
 
 
192 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  28.19 
 
 
191 aa  57  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  29.53 
 
 
192 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  29.53 
 
 
192 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  29.53 
 
 
192 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2572  hypothetical protein  27.66 
 
 
398 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.376371  normal  0.186015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  29.53 
 
 
191 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  25.26 
 
 
192 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  28.19 
 
 
222 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  28.38 
 
 
418 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  27.46 
 
 
338 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  25.15 
 
 
560 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  25.26 
 
 
192 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  26.85 
 
 
192 aa  54.3  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  36.78 
 
 
232 aa  53.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  27.52 
 
 
191 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  27.7 
 
 
191 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>