188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3818 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  100 
 
 
493 aa  973    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  86.98 
 
 
479 aa  353  2.9999999999999997e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  62.3 
 
 
528 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3190  stress protein  55.21 
 
 
192 aa  197  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029979  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0274  stress protein  49.74 
 
 
197 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0893  stress protein  51.6 
 
 
194 aa  178  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0767  stress protein  45.13 
 
 
202 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0761  tellurium resitance protein TerZ  45.13 
 
 
202 aa  170  5e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00228615  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3308  stress protein  50 
 
 
192 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195262  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0824  stress protein  48.91 
 
 
189 aa  166  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0079  stress protein  42.93 
 
 
205 aa  166  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.244583  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33940  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  48.37 
 
 
191 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307138  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1008  stress protein  45.21 
 
 
195 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1350  tellurium resistance protein TerZ  47.31 
 
 
193 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00284326  normal  0.578041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0940  tellurium resistance protein TerZ  48.15 
 
 
197 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0808  stress protein  47.62 
 
 
197 aa  163  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343161  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  47.85 
 
 
411 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4657  stress protein  43.01 
 
 
193 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325263  normal  0.761079 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3877  stress protein  45.08 
 
 
197 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000165459  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0635  stress response protein  43.3 
 
 
193 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3789  tellurium resistance protein  45.08 
 
 
197 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0662  tellurium resistance protein  45.08 
 
 
208 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000181473  normal  0.379658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3694  stress protein  45.16 
 
 
193 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00340813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  54.04 
 
 
413 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  45.78 
 
 
449 aa  139  7.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3019  stress protein  42.86 
 
 
193 aa  137  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000174697  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  51.37 
 
 
401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  40.57 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  47.43 
 
 
191 aa  125  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  43.33 
 
 
191 aa  123  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  37.1 
 
 
200 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  40 
 
 
192 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  42.46 
 
 
192 aa  121  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  39.43 
 
 
192 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  42.29 
 
 
191 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  43.33 
 
 
191 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  38.5 
 
 
200 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  36.95 
 
 
199 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  39.66 
 
 
191 aa  119  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  36.95 
 
 
199 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  42.29 
 
 
194 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  43.24 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  38.86 
 
 
192 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  41.14 
 
 
192 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  41.14 
 
 
196 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  41.14 
 
 
196 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  41.14 
 
 
194 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  41.14 
 
 
194 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  41.14 
 
 
194 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  42.29 
 
 
191 aa  118  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  41.14 
 
 
196 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  37.23 
 
 
191 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  42.29 
 
 
192 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  41.14 
 
 
194 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  41.14 
 
 
194 aa  117  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  40.22 
 
 
191 aa  116  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  41.14 
 
 
194 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  38.86 
 
 
192 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  40.22 
 
 
191 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  42.86 
 
 
191 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  37.44 
 
 
198 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  40.57 
 
 
222 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  39.43 
 
 
192 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  40 
 
 
192 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  38.89 
 
 
248 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  40.43 
 
 
190 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  39.43 
 
 
191 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  40 
 
 
194 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  39.43 
 
 
192 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  44.38 
 
 
560 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  38.86 
 
 
191 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  40 
 
 
192 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  38.5 
 
 
192 aa  114  5e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0379  stress protein  37.44 
 
 
198 aa  114  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  41.71 
 
 
191 aa  113  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  36.92 
 
 
198 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  36.92 
 
 
198 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  36.92 
 
 
198 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  36.92 
 
 
198 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  36.92 
 
 
198 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  42.29 
 
 
191 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  38.86 
 
 
191 aa  113  9e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  38.86 
 
 
191 aa  113  9e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  36.92 
 
 
198 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  42.29 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0373  TerD family tellurium resistance protein  36.41 
 
 
198 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  36.41 
 
 
198 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  38.29 
 
 
192 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  38.89 
 
 
191 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  40 
 
 
192 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  40.66 
 
 
194 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  37.76 
 
 
198 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>