24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1562 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  477  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  45.45 
 
 		 233 aa  165  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  43.06 
 
 		 226 aa  155  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  41.9 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  42.58 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  40.85 
 
 		 401 aa  142  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  41.23 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  38.6 
 
 		 402 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  36.87 
 
 		 404 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  35.61 
 
 		 389 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  35.81 
 
 		 418 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  35.61 
 
 		 401 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  32.69 
 
 		 385 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  32.21 
 
 		 394 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  32.21 
 
 		 394 aa  104  9e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  32.21 
 
 		 394 aa  104  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  36.18 
 
 		 432 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  34.13 
 
 		 384 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  31.94 
 
 		 427 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  30.89 
 
 		 419 aa  95.5  7e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  34.46 
 
 		 412 aa  94  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  29.81 
 
 		 370 aa  85.1  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6385  stress protein  27.35 
 
 		 568 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0413348  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3309  hypothetical protein  26.5 
 
 		 279 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.151358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>