26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4753 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  100 
 
 
244 aa  497  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  58.29 
 
 
233 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  49.61 
 
 
225 aa  221  9e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  50.67 
 
 
245 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  48.44 
 
 
226 aa  211  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  48.56 
 
 
389 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  48.29 
 
 
401 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  48.78 
 
 
402 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  41.03 
 
 
432 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  42.53 
 
 
394 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  42.53 
 
 
394 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  42.53 
 
 
394 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  45.5 
 
 
401 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  44.1 
 
 
404 aa  174  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  46.89 
 
 
418 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  45.59 
 
 
385 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  44.12 
 
 
384 aa  169  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  38.35 
 
 
427 aa  160  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  40.34 
 
 
419 aa  158  7e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  38.1 
 
 
412 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  42.11 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  36.59 
 
 
370 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6385  stress protein  31.41 
 
 
568 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0413348  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3309  hypothetical protein  29.21 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  34.65 
 
 
232 aa  61.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3022  hypothetical protein  23.32 
 
 
436 aa  42.7  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035487  hitchhiker  0.00076549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>