25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0404 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  490  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  57.92 
 
 		 233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  53.27 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  56.54 
 
 		 225 aa  216  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  53.81 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  50 
 
 		 389 aa  188  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  49.07 
 
 		 401 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  43.36 
 
 		 394 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  43.36 
 
 		 394 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  43.36 
 
 		 394 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  46.26 
 
 		 385 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  46.26 
 
 		 402 aa  170  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  41.1 
 
 		 432 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  40.57 
 
 		 419 aa  164  8e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  44.39 
 
 		 384 aa  163  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  43.58 
 
 		 427 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  41.67 
 
 		 412 aa  156  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  45.83 
 
 		 418 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  41.52 
 
 		 404 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  41.71 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  42.2 
 
 		 401 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  33.48 
 
 		 370 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6385  stress protein  30.82 
 
 		 568 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0413348  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  41.11 
 
 		 232 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3309  hypothetical protein  23.56 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.151358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>