137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0345 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  100 
 
 
232 aa  480  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  56.35 
 
 
432 aa  214  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  39.68 
 
 
419 aa  123  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  42.6 
 
 
394 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  42.6 
 
 
394 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  42.6 
 
 
394 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  43.03 
 
 
384 aa  113  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  36.55 
 
 
427 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  36.46 
 
 
412 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  42.35 
 
 
402 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  36.61 
 
 
404 aa  108  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  40.61 
 
 
385 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  37.69 
 
 
401 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  40.61 
 
 
389 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  34.93 
 
 
402 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  34.93 
 
 
401 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  35.71 
 
 
418 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  33.73 
 
 
370 aa  94.4  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  32.54 
 
 
401 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  35.88 
 
 
401 aa  82.8  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  62.26 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  62.26 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  62.26 
 
 
196 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  62.26 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  62.26 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  62.26 
 
 
194 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  60.38 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  60.38 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  60.38 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  60.38 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  60.38 
 
 
194 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  51.85 
 
 
192 aa  75.1  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  49.06 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  49.06 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  49.06 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  49.06 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  49.06 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  49.06 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  49.06 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  49.06 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  49.06 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  49.06 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  42.42 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  47.17 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  46.3 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  44.44 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  43.4 
 
 
192 aa  66.6  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  41.07 
 
 
192 aa  66.2  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  41.24 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  39.6 
 
 
245 aa  63.9  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  38.89 
 
 
248 aa  63.2  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  43.4 
 
 
192 aa  62.8  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  42 
 
 
191 aa  62.4  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  40.38 
 
 
191 aa  62  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  34.82 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  42 
 
 
191 aa  61.6  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  46.3 
 
 
191 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  40.62 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  42.59 
 
 
191 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  39.13 
 
 
191 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  34.67 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  40 
 
 
192 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  37.88 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  37.88 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  41.51 
 
 
192 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  27.5 
 
 
427 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  37.5 
 
 
493 aa  58.5  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  42.59 
 
 
192 aa  58.5  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  43.4 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  39.62 
 
 
191 aa  57  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  37.74 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  37.74 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  43.4 
 
 
191 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  40.58 
 
 
479 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  34.25 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  40.74 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  42.31 
 
 
191 aa  55.8  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  37.04 
 
 
192 aa  55.1  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  38.1 
 
 
190 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  34.29 
 
 
433 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  38.55 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  35.63 
 
 
449 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  40.74 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  37.04 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  36.54 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  33.33 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  39.62 
 
 
191 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2996  stress protein  44.19 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0312721  normal  0.678012 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  39.62 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  39.62 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  39.62 
 
 
191 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  35.85 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  39.62 
 
 
222 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  41.18 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  38.57 
 
 
453 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  30.56 
 
 
191 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  36 
 
 
191 aa  52  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  38.46 
 
 
191 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  43.4 
 
 
413 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>