15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3309 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3309  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  545  1e-154  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.151358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6385  stress protein  43.22 
 
 
568 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0413348  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  28.14 
 
 
244 aa  81.6  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  25.26 
 
 
401 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3022  hypothetical protein  28.5 
 
 
436 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035487  hitchhiker  0.00076549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  28 
 
 
401 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  23.96 
 
 
233 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  24.51 
 
 
389 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  24.7 
 
 
402 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  26.5 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  26.15 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  25 
 
 
226 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  24.5 
 
 
384 aa  50.8  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  26.06 
 
 
418 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  23.18 
 
 
245 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>