25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1057 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1057  tellurium resistance protein TerA  100 
 
 
226 aa  454  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614683  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3675  putative tellurium resistance protein TerA  84.14 
 
 
225 aa  369  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.433163 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3016  tellurium resistance protein TerA  53.85 
 
 
233 aa  229  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000734851  decreased coverage  0.000036152 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4753  Tellurium resistance  48.83 
 
 
244 aa  222  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  46.33 
 
 
394 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  46.33 
 
 
394 aa  205  6e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  46.33 
 
 
394 aa  205  6e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  45.33 
 
 
432 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0404  hypothetical protein  54.24 
 
 
245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.184039  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  49.52 
 
 
389 aa  198  5e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  48.58 
 
 
401 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  48.57 
 
 
402 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  44.2 
 
 
419 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  46.41 
 
 
385 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  42.79 
 
 
427 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  45.05 
 
 
404 aa  182  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  41.71 
 
 
412 aa  177  1e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3695  Tellurium resistance  43.06 
 
 
384 aa  176  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00168572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  45.28 
 
 
418 aa  176  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  44.19 
 
 
401 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1562  hypothetical protein  43.81 
 
 
233 aa  158  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0473387  normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2005  stress protein, tellurium resistance protein TerD  37.5 
 
 
370 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.432333  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0345  hypothetical protein  37.31 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6385  stress protein  26.94 
 
 
568 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0413348  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3309  hypothetical protein  25.59 
 
 
279 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.151358 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>