180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3018 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3018  stress protein  100 
 
 		 722 aa  1429    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  47.94 
 
 		 689 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2755  hypothetical protein  46.45 
 
 		 459 aa  356  7.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  34.87 
 
 		 675 aa  346  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0563  hypothetical protein  33.42 
 
 		 473 aa  184  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  41.62 
 
 		 289 aa  136  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  41.81 
 
 		 528 aa  117  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  48.39 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  41.81 
 
 		 479 aa  109  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  37.97 
 
 		 192 aa  108  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  39.36 
 
 		 191 aa  106  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  34.76 
 
 		 192 aa  103  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  37.43 
 
 		 191 aa  102  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  38.85 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  33.69 
 
 		 248 aa  101  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  37.43 
 
 		 191 aa  100  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  35.29 
 
 		 191 aa  100  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  36.36 
 
 		 191 aa  99.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  35.09 
 
 		 590 aa  99  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  35.83 
 
 		 222 aa  99  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  38.67 
 
 		 449 aa  98.6  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  35.29 
 
 		 192 aa  98.2  5e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  35.83 
 
 		 191 aa  97.8  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  35.64 
 
 		 191 aa  97.4  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  35.64 
 
 		 191 aa  97.4  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  37.23 
 
 		 192 aa  97.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  35.64 
 
 		 191 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  35.64 
 
 		 191 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  32.97 
 
 		 192 aa  95.9  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  32.97 
 
 		 192 aa  95.9  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  32.97 
 
 		 192 aa  95.9  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  34.05 
 
 		 192 aa  95.5  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  36.36 
 
 		 191 aa  95.9  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  36.56 
 
 		 191 aa  95.5  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  39.43 
 
 		 437 aa  95.1  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  34.76 
 
 		 192 aa  94  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  32.97 
 
 		 192 aa  93.6  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  35.29 
 
 		 191 aa  93.6  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  33.51 
 
 		 191 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  34.39 
 
 		 192 aa  92.8  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  33.51 
 
 		 191 aa  92.8  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  34.22 
 
 		 191 aa  91.7  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  33.16 
 
 		 191 aa  91.3  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  31.55 
 
 		 192 aa  90.9  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  35.11 
 
 		 192 aa  90.5  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  33.16 
 
 		 191 aa  89.4  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  34.76 
 
 		 191 aa  89.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  36.36 
 
 		 192 aa  88.6  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  39.11 
 
 		 611 aa  88.6  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  33.16 
 
 		 191 aa  88.6  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  35.29 
 
 		 191 aa  88.6  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  27.47 
 
 		 186 aa  88.6  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  34.22 
 
 		 191 aa  87.8  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  32.26 
 
 		 192 aa  87.8  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  36.61 
 
 		 545 aa  87.8  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  34.57 
 
 		 192 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 192 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  39.44 
 
 		 413 aa  86.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  33.87 
 
 		 192 aa  87  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  34.04 
 
 		 192 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 192 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 192 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 192 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 192 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  33.16 
 
 		 191 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  35.45 
 
 		 493 aa  85.9  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  31.72 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  32.98 
 
 		 191 aa  85.5  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  32.8 
 
 		 192 aa  85.5  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  33.89 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  35.2 
 
 		 402 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  32.26 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  29.35 
 
 		 433 aa  83.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  32.62 
 
 		 205 aa  83.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  25.82 
 
 		 401 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  35.59 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  34.46 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  30.69 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  30.69 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  30.69 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  30.69 
 
 		 194 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  30.69 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  30.69 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0763  stress protein  32.78 
 
 		 427 aa  80.5  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  32.43 
 
 		 190 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  30.16 
 
 		 194 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  37.44 
 
 		 317 aa  80.5  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  31.38 
 
 		 194 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  31.38 
 
 		 194 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  30.69 
 
 		 194 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  30.16 
 
 		 196 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  30.86 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  25.27 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  25.27 
 
 		 401 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  30.16 
 
 		 194 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  31.33 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  31.02 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  31.33 
 
 		 192 aa  77.8  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  34.48 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>