178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  100 
 
 
689 aa  1353    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  47.06 
 
 
722 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2755  hypothetical protein  49.41 
 
 
459 aa  399  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  36.47 
 
 
675 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0563  hypothetical protein  35.73 
 
 
473 aa  224  4e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  54.3 
 
 
289 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  53.42 
 
 
528 aa  146  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  50 
 
 
401 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  47.22 
 
 
560 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  49.02 
 
 
192 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  44.44 
 
 
191 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  44.94 
 
 
192 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  44.16 
 
 
191 aa  114  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  42.76 
 
 
191 aa  114  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  44.44 
 
 
193 aa  114  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  42.76 
 
 
191 aa  112  3e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  44.16 
 
 
192 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  40.76 
 
 
590 aa  112  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  40.91 
 
 
192 aa  112  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  42.48 
 
 
191 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  41.83 
 
 
191 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  43.51 
 
 
449 aa  111  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  43.79 
 
 
191 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  42.11 
 
 
191 aa  110  6e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  39.35 
 
 
192 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  43.14 
 
 
191 aa  110  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  43.14 
 
 
205 aa  107  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  40.26 
 
 
192 aa  107  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  35.71 
 
 
248 aa  107  1e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  42.48 
 
 
191 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  40.65 
 
 
191 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  42.67 
 
 
191 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  46.75 
 
 
479 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  41.29 
 
 
191 aa  105  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  40.4 
 
 
190 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  38.96 
 
 
192 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  38.96 
 
 
192 aa  105  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  38.96 
 
 
192 aa  105  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  35.62 
 
 
402 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  35.62 
 
 
401 aa  104  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  41.83 
 
 
222 aa  104  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  41.83 
 
 
191 aa  104  7e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  37.5 
 
 
191 aa  103  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  37.5 
 
 
191 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  43.87 
 
 
493 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  38.16 
 
 
194 aa  101  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  34.84 
 
 
401 aa  100  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  38.16 
 
 
191 aa  100  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  36.77 
 
 
196 aa  99.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  38.16 
 
 
191 aa  100  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  36.77 
 
 
196 aa  99.8  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  38.16 
 
 
191 aa  100  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  38.16 
 
 
194 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  37.5 
 
 
196 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  36.77 
 
 
194 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  36.77 
 
 
194 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  36.77 
 
 
194 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  36.77 
 
 
194 aa  99.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  37.5 
 
 
194 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  40.52 
 
 
191 aa  98.2  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  38.16 
 
 
191 aa  98.2  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  40.13 
 
 
191 aa  98.2  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  38.56 
 
 
192 aa  97.1  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  40.26 
 
 
192 aa  97.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  36.84 
 
 
191 aa  97.1  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  36.18 
 
 
194 aa  96.3  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  39.33 
 
 
192 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  39.33 
 
 
192 aa  95.5  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  39.33 
 
 
192 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  39.33 
 
 
192 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  39.33 
 
 
192 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  39.33 
 
 
192 aa  95.5  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  33.33 
 
 
192 aa  95.1  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  36.6 
 
 
191 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  40.54 
 
 
401 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  39.33 
 
 
192 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  36.6 
 
 
192 aa  94.7  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  36.6 
 
 
192 aa  94  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  47.22 
 
 
413 aa  94  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  40.52 
 
 
545 aa  93.2  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  34.63 
 
 
394 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  35.06 
 
 
192 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  32.5 
 
 
186 aa  92.8  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  34.63 
 
 
394 aa  92.8  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  33.54 
 
 
428 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  36.6 
 
 
191 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  34.63 
 
 
394 aa  92.8  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  36.13 
 
 
418 aa  92  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  35.29 
 
 
192 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  38.51 
 
 
389 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  38.67 
 
 
192 aa  90.9  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  39.47 
 
 
194 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  36 
 
 
192 aa  90.5  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  37.33 
 
 
192 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  30 
 
 
433 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  39.04 
 
 
411 aa  88.2  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  38.16 
 
 
194 aa  87  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  38.16 
 
 
194 aa  87  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  39.16 
 
 
338 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  34.72 
 
 
190 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>