148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4448 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4448  stress protein  100 
 
 		 675 aa  1352    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.212385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18980  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  37.22 
 
 		 689 aa  371  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.276836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3018  stress protein  34.59 
 
 		 722 aa  349  9e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000801006  decreased coverage  0.0000799018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2755  hypothetical protein  38.05 
 
 		 459 aa  279  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0563  hypothetical protein  30.36 
 
 		 473 aa  157  4e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  44.67 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0654  stress protein  39.04 
 
 		 289 aa  107  7e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.94614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3708  protein of unknown function DUF124  37.37 
 
 		 449 aa  107  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.737309  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  36.5 
 
 		 493 aa  104  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1589  stress protein  41.18 
 
 		 401 aa  100  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00887419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  37.5 
 
 		 191 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  35.19 
 
 		 191 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  36.24 
 
 		 191 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  34.78 
 
 		 191 aa  93.6  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  35.19 
 
 		 191 aa  93.2  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  32.89 
 
 		 194 aa  93.6  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  33.33 
 
 		 191 aa  93.6  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  28.12 
 
 		 428 aa  92.8  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  33.33 
 
 		 191 aa  93.2  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  33.33 
 
 		 191 aa  93.2  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0872  tellurium resistance protein  31.95 
 
 		 402 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0926  tellurium resistance protein  31.95 
 
 		 401 aa  91.3  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  33.33 
 
 		 479 aa  91.3  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  34.23 
 
 		 191 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  36.42 
 
 		 192 aa  89.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  35.76 
 
 		 192 aa  89  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 196 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 196 aa  88.2  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 194 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 196 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  32.45 
 
 		 192 aa  88.2  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  37.75 
 
 		 191 aa  88.2  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 194 aa  87.8  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 194 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 194 aa  87.8  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  31.13 
 
 		 192 aa  87.4  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  32.12 
 
 		 191 aa  87.4  8e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1095  putative tellurium resistance protein  30.77 
 
 		 401 aa  87.4  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 194 aa  87  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  33.56 
 
 		 191 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  32.28 
 
 		 191 aa  87  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  29.61 
 
 		 194 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  30.26 
 
 		 194 aa  87  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  31.54 
 
 		 192 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  35.76 
 
 		 191 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  34.22 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  35.71 
 
 		 191 aa  85.1  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  35.05 
 
 		 205 aa  85.1  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  35.1 
 
 		 192 aa  85.1  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  35.76 
 
 		 222 aa  85.1  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  35.76 
 
 		 191 aa  84.7  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  36.36 
 
 		 191 aa  84.3  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4769  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  38.85 
 
 		 590 aa  84  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.156881  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  31.79 
 
 		 192 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  35.1 
 
 		 191 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  33.77 
 
 		 192 aa  83.6  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0263  stress protein  36.6 
 
 		 413 aa  83.2  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120837 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  30.87 
 
 		 192 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  31.25 
 
 		 191 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  34.44 
 
 		 191 aa  82  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  30.2 
 
 		 192 aa  82.4  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  33.77 
 
 		 192 aa  82.4  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  31.79 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  31.13 
 
 		 192 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  33.12 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  31.13 
 
 		 248 aa  79.7  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6399  stress protein  34.76 
 
 		 560 aa  79.3  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.266447  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0273  stress protein  35.62 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3457  Allergen V5/Tpx-1 related  36.67 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35510  DNA polymerase III epsilon subunit-like 3'-5' exonuclease  37.68 
 
 		 611 aa  78.2  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  30.32 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1282  SCP-like extracellular  34.44 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  32.21 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  30.87 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2988  stress protein  31.08 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186461 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  35.06 
 
 		 191 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  32.49 
 
 		 193 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  35.06 
 
 		 191 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3788  tellurite resistance protein  25.23 
 
 		 394 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000690158  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0663  tellurite resistance protein  25.23 
 
 		 394 aa  77  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000164398  normal  0.444043 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3876  stress protein  25.23 
 
 		 394 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000202647  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2904  hypothetical protein  33.33 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  30.38 
 
 		 191 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  30 
 
 		 192 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  30 
 
 		 192 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  30 
 
 		 192 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  32.89 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0809  stress protein  33.11 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.616867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4663  stress protein  35.37 
 
 		 404 aa  73.9  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.298991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0941  tellurium resistance protein TerA  32.43 
 
 		 401 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0760  tellurium resistance protein  22.71 
 
 		 419 aa  73.6  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0966858  normal  0.220902 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4644  stress protein  25.6 
 
 		 427 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2192  stress protein  34.42 
 
 		 437 aa  72.8  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0544728  hitchhiker  0.0012944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2309  hypothetical protein  30.46 
 
 		 532 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.739249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0825  stress protein  35.62 
 
 		 545 aa  72  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1351  TerA  34.67 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000447285  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  30.2 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  31.08 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0080  stress protein  31.29 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37550  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  29.74 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>