182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_37550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_37550  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  100 
 
 
190 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3023  stress protein  37.63 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0102186  hitchhiker  0.000574983 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  39.47 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  37.57 
 
 
191 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  39.36 
 
 
191 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  37.04 
 
 
222 aa  128  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  37.04 
 
 
191 aa  128  6e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  35.08 
 
 
192 aa  127  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1849  stress protein  39.27 
 
 
205 aa  125  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0360395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  35.45 
 
 
192 aa  124  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  34.03 
 
 
191 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  35.64 
 
 
192 aa  121  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  35.42 
 
 
191 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  35.98 
 
 
191 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  32.45 
 
 
191 aa  119  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3065  stress protein  36.32 
 
 
193 aa  119  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  32.45 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  32.46 
 
 
192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  32.45 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  32.45 
 
 
191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  32.98 
 
 
191 aa  118  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  33.16 
 
 
191 aa  117  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  32.46 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  34.92 
 
 
191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  32.28 
 
 
192 aa  114  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  33.51 
 
 
191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  30.73 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  32.45 
 
 
191 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  32.45 
 
 
191 aa  111  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  29.79 
 
 
192 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  31.38 
 
 
191 aa  109  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6572  stress protein  33.33 
 
 
194 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  32.99 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  32.45 
 
 
191 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0514  tellurium resistance protein  32.47 
 
 
194 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000566195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0386  tellurium resistance protein  32.47 
 
 
196 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00658457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  32.47 
 
 
196 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  29.79 
 
 
191 aa  105  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  32.47 
 
 
194 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0444  tellurium resistance protein  32.47 
 
 
194 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  29.95 
 
 
192 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  29.95 
 
 
192 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  29.95 
 
 
192 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  31.25 
 
 
191 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  31.05 
 
 
190 aa  104  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0514  tellurium resistance protein  31.96 
 
 
194 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4859  tellurium resistance protein  31.96 
 
 
194 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.311448  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  29.79 
 
 
192 aa  103  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0465  tellurium resistance protein  31.96 
 
 
194 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  30.89 
 
 
191 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  29.79 
 
 
191 aa  102  3e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  29.79 
 
 
192 aa  102  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0380  stress protein  30.41 
 
 
194 aa  102  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  29.32 
 
 
191 aa  102  4e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  28.57 
 
 
248 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  31.91 
 
 
192 aa  101  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  31.38 
 
 
192 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  31.91 
 
 
192 aa  101  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  31.38 
 
 
191 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0263  stress protein  31.38 
 
 
194 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  30.41 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1939  stress protein  31.22 
 
 
184 aa  97.8  9e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0105651 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0892  stress protein  30.05 
 
 
418 aa  95.9  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0707  stress protein  27.07 
 
 
190 aa  95.5  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1508  stress protein  34.18 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5062  stress protein  28.04 
 
 
189 aa  92  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.416772 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0577  stress protein  27.89 
 
 
192 aa  90.5  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.93235 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1264  stress protein, tellurium resistance protein  27.66 
 
 
191 aa  89  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153753  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  28.64 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2078  stress protein  26.84 
 
 
192 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  28.64 
 
 
199 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  25 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2120  stress protein  27.37 
 
 
192 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.660926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5063  stress protein  25.41 
 
 
191 aa  88.2  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2076  stress protein  27.37 
 
 
192 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  28.27 
 
 
192 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  27.37 
 
 
192 aa  87  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1600  stress protein  26.34 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  27.75 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2122  stress protein  26.84 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0739458  normal  0.468561 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  27.75 
 
 
192 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  28.42 
 
 
192 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0338  stress protein  28.57 
 
 
192 aa  85.1  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  27.37 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  27.37 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  27.37 
 
 
192 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1169  stress protein  28.18 
 
 
184 aa  84.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  26.7 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1164  stress protein  26.78 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  28.34 
 
 
198 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  27 
 
 
200 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0387  tellurium resistance protein  27.08 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000558292  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0401  tellurium resistance protein  27.08 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0274  stress protein  31.03 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  27.03 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2992  stress protein  25.95 
 
 
432 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000268445  normal  0.372941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  28.34 
 
 
198 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0378  stress protein, tellurium resistance TerD  25.27 
 
 
428 aa  75.1  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  28.34 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  28.34 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>