161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4657 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4657  stress protein  100 
 
 
193 aa  398  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325263  normal  0.761079 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0079  stress protein  65.2 
 
 
205 aa  272  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.244583  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0761  tellurium resitance protein TerZ  64.68 
 
 
202 aa  265  4e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00228615  normal  0.0996912 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0767  stress protein  64.68 
 
 
202 aa  264  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.393122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1008  stress protein  63.08 
 
 
195 aa  262  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33940  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  60.62 
 
 
191 aa  249  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307138  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0635  stress response protein  61.86 
 
 
193 aa  244  6.999999999999999e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3190  stress protein  56.99 
 
 
192 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029979  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0824  stress protein  57.29 
 
 
189 aa  222  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0893  stress protein  56.02 
 
 
194 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3308  stress protein  53.85 
 
 
192 aa  215  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.195262  normal  0.460573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0274  stress protein  55.32 
 
 
197 aa  211  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0940  tellurium resistance protein TerZ  54.26 
 
 
197 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0808  stress protein  54.26 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.343161  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3019  stress protein  51.06 
 
 
193 aa  194  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000174697  hitchhiker  0.000454743 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3694  stress protein  48.4 
 
 
193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00340813  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3789  tellurium resistance protein  48.44 
 
 
197 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000192463  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0662  tellurium resistance protein  48.44 
 
 
208 aa  169  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000181473  normal  0.379658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3877  stress protein  48.44 
 
 
197 aa  169  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000165459  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4765  stress protein  46.07 
 
 
411 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.428894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1350  tellurium resistance protein TerZ  46.81 
 
 
193 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00284326  normal  0.578041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0900  stress protein  45.7 
 
 
479 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.204273 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3818  stress protein  43.01 
 
 
493 aa  158  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.139495  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2121  stress protein  45.41 
 
 
199 aa  157  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0366485  normal  0.638997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2077  stress protein  45.41 
 
 
199 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0336  stress protein  44.26 
 
 
190 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0386  stress protein  45.6 
 
 
192 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.761151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33930  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  38.25 
 
 
528 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.333866  normal  0.940831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3799  stress protein  44.26 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.331273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0576  stress protein  45.7 
 
 
200 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0633  stress response protein  45.36 
 
 
192 aa  142  3e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0384  stress protein  42.64 
 
 
198 aa  142  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3193  stress protein  41.53 
 
 
191 aa  141  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0230614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4495  stress protein  41.95 
 
 
190 aa  140  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0812  stress protein  43.41 
 
 
191 aa  140  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0927338  normal  0.415217 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0515  tellurium resistance protein  44.51 
 
 
192 aa  140  9e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204863  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0375  TerD family tellurium resistance protein  44.51 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000676641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3311  stress protein  44.02 
 
 
191 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.136356 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0385  tellurium resistance protein  42.13 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0376  TerD family tellurium resistance protein  42.13 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1002  stress protein  41.53 
 
 
192 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.113516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0399  tellurium resistance protein  42.13 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.770902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0464  putative tellurium resistance protein  42.13 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000175356  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4860  putative tellurium resistance protein  42.13 
 
 
198 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.453305  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0515  tellurium resistance protein  43.96 
 
 
192 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742736  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0378  TerD family tellurium resistance protein  43.96 
 
 
192 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0937193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4858  tellurium resistance protein  43.96 
 
 
192 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00851793  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0513  putative tellurium resistance protein  42.13 
 
 
198 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0111767  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0077  stress protein  44.26 
 
 
191 aa  139  3e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000662934  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0445  tellurium resistance protein  43.96 
 
 
192 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3192  stress protein  43.72 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0443  putative tellurium resistance protein  41.62 
 
 
198 aa  138  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2993  stress protein  41.53 
 
 
191 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125337  normal  0.482058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0337  stress protein  45.95 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0373  TerD family tellurium resistance protein  41.12 
 
 
198 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0575  stress protein  43.17 
 
 
191 aa  137  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.967335 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3677  stress protein  41.53 
 
 
191 aa  137  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0513  tellurium resistance protein, putative  40.61 
 
 
198 aa  136  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0381  stress protein  43.41 
 
 
192 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0270  stress protein  41.53 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.384965 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0466  tellurium resistance protein  42.86 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3020  stress protein  39.89 
 
 
191 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000240032  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1054  stress protein  40.98 
 
 
191 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0894  stress protein  40.44 
 
 
192 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3785  tellurium resistance protein  39.89 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0102756  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0666  tellurium resistance protein  39.89 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00208904  normal  0.398631 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3873  stress protein  39.89 
 
 
192 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.45375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33960  uncharacterized stress response protein, TerZ- and CABP1  41.53 
 
 
191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0635194  normal  0.586305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0379  stress protein  40.61 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0944  tellurium resistance protein TerD  40.98 
 
 
191 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0771  stress protein  40.98 
 
 
191 aa  132  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0667  tellurium resistance protein  41.53 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00182749  normal  0.415097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3872  stress protein  41.53 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3021  stress protein  41.53 
 
 
192 aa  131  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00454465  hitchhiker  0.000498686 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2575  stress protein, tellurium resistance protein  42.62 
 
 
191 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0599236  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1355  tellurite resistance  40.98 
 
 
191 aa  130  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00275499  normal  0.607229 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0765  tellurium resistance protein  40.98 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.105936 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5053  stress protein  38.17 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384692  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3784  tellurium resistance protein  41.53 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.049745  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4751  stress protein  40.44 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0945  tellurium resistance protein TerE  42.08 
 
 
192 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1354  tellurium resistance protein TerD  39.34 
 
 
192 aa  129  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0010671  normal  0.701681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0813  stress protein  41.53 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.492413  normal  0.641947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1940  stress protein  37 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3698  stress protein  38.25 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.335796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3014  stress protein  39.34 
 
 
191 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285537  decreased coverage  0.0000397656 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4654  stress protein  39.89 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0674127  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4435  stress protein  38.8 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263742  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0269  stress protein  39.89 
 
 
192 aa  125  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.394483 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3699  stress protein  40.44 
 
 
191 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0763  tellurium resistance TerD  38.25 
 
 
191 aa  124  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.219887  normal  0.186323 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0769  stress protein  38.25 
 
 
191 aa  124  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0634  stress response protein  41.53 
 
 
248 aa  122  2e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0385  stress protein  38.12 
 
 
194 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1266  stress protein, tellurium resistance protein  39.89 
 
 
192 aa  121  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169653  normal  0.976028 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4655  stress protein  37.16 
 
 
191 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117169  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0075  stress protein  40.98 
 
 
191 aa  121  7e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0162917  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0374  TerD family tellurium resistance protein  37.02 
 
 
196 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0190883  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0377  TerD family tellurium resistance protein  37.02 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0400  tellurium resistance protein  37.02 
 
 
194 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.909133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>