17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4621 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4621  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  397  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4735  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 
464 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1989  integrase catalytic subunit  83.33 
 
 
464 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0157211  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0670  putative transposase  50.57 
 
 
462 aa  91.7  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0369159  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1843  transposase  53.33 
 
 
491 aa  91.3  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0142418 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4300  integrase catalytic region  47.87 
 
 
468 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3832  integrase catalytic subunit  46.24 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322894  normal  0.205763 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6516  integrase catalytic subunit  46.24 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.983833  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1677  integrase catalytic region  45.16 
 
 
496 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257705  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1084  integrase catalytic region  46.15 
 
 
494 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.310886 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6204  integrase catalytic region  45.16 
 
 
496 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18431  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5175  Integrase catalytic region  43.48 
 
 
477 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3038  integrase catalytic subunit  52.63 
 
 
417 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.158166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2121  Integrase catalytic region  44 
 
 
468 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.224793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2648  Integrase catalytic region  44 
 
 
468 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4696  Integrase catalytic region  39.66 
 
 
432 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.019819  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4092  integrase catalytic subunit  39.66 
 
 
431 aa  42  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>