39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4626 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4626  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  100 
 
 		 329 aa  676    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2927  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  77.51 
 
 		 329 aa  554  1e-157  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4781  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  63.64 
 
 		 330 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2784  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  60.91 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0992918  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4963  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  60.91 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344185  normal  0.0433285 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4810  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  60.91 
 
 		 330 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0600272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0812  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  43.64 
 
 		 336 aa  288  7e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.16931  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2225  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  43.43 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1912  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  43.64 
 
 		 330 aa  281  8.000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.605921  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2046  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase (OhpC)  43.43 
 
 		 327 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559961  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2537  putative 4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  41.28 
 
 		 342 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2513  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  36.96 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.183334 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4214  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  35.26 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3157  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  35.65 
 
 		 324 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487301  normal  0.0634262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3999  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  36.93 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  hitchhiker  0.00546474 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1239  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  32.73 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1235  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  32.42 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2662  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  32.43 
 
 		 330 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1236  4,5-dihydroxyphthalate decarboxylase  31.48 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3748  hypothetical protein  29.84 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3919  hypothetical protein  33.94 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.678448 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3273  hypothetical protein  30.27 
 
 		 324 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5224  hypothetical protein  29.91 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.175416 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3278  hypothetical protein  30.84 
 
 		 305 aa  120  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148142 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0386  hypothetical protein  30.04 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.477344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3917  hypothetical protein  27.86 
 
 		 704 aa  106  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197264  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2840  hypothetical protein  27.74 
 
 		 326 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.94623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0043  hypothetical protein  28.22 
 
 		 330 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5409  hypothetical protein  25.72 
 
 		 320 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3918  hypothetical protein  24.06 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.517895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0838  taurine transporter substrate binding subunit  27.23 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3242  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00315  taurine transporter subunit  26.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00319  hypothetical protein  26.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0440  taurine transporter substrate binding subunit  26.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3263  taurine transporter substrate binding subunit  26.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0389  taurine transporter substrate binding subunit  26.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0428  taurine transporter substrate binding subunit  26.76 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0394  taurine transporter substrate binding subunit  26.05 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.560594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>