9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4612 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4612  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  110  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3826  amidase  84.62 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1658  amidase  67.57 
 
 		 507 aa  50.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5467  amidase  58.97 
 
 		 508 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0261101 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1465  amidase  71.88 
 
 		 535 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0709  Amidase  59.46 
 
 		 507 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4617  amidase  62.86 
 
 		 506 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.130864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2430  amidase  60 
 
 		 522 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.656573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2402  amidase  64.29 
 
 		 492 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.574141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>