27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4659 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  100 
 
 
384 aa  782    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  42.29 
 
 
386 aa  275  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  40.97 
 
 
380 aa  259  7e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  41.87 
 
 
375 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  39.69 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  38.8 
 
 
377 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  41.06 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  41.06 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  41.06 
 
 
378 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  38.42 
 
 
380 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  32.99 
 
 
426 aa  199  5e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  36.66 
 
 
372 aa  194  3e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  31.2 
 
 
425 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  31.65 
 
 
423 aa  187  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  28.64 
 
 
441 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  28 
 
 
360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  27.75 
 
 
458 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  26.17 
 
 
448 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  27.63 
 
 
404 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  26.7 
 
 
404 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  30.95 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  30.15 
 
 
467 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  27.64 
 
 
430 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  31.9 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  28.8 
 
 
530 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  29.92 
 
 
460 aa  73.9  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  33.16 
 
 
516 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>