27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1003 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  764    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  40.81 
 
 		 375 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  36.9 
 
 		 360 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  41.84 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  41.84 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  41.84 
 
 		 378 aa  215  9e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  39.77 
 
 		 380 aa  215  9.999999999999999e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  39.04 
 
 		 386 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  40.41 
 
 		 380 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  37.22 
 
 		 377 aa  203  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  37.22 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  36.66 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  34.44 
 
 		 423 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  34.43 
 
 		 425 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  32.61 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  31.78 
 
 		 430 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  28.9 
 
 		 448 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  28.5 
 
 		 441 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  29.05 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  28.8 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  28.8 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  29.63 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  29.25 
 
 		 452 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  30.91 
 
 		 454 aa  89.7  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  26.92 
 
 		 467 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  36.96 
 
 		 516 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  26.28 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>