30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3012 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  48.32 
 
 
467 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  42.74 
 
 
530 aa  256  8e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  40.95 
 
 
430 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  44.89 
 
 
460 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  44.44 
 
 
452 aa  219  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  42.58 
 
 
516 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  28.54 
 
 
448 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  29.92 
 
 
404 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  29.69 
 
 
404 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  31.7 
 
 
458 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  28.99 
 
 
441 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  29.68 
 
 
380 aa  103  8e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  31.65 
 
 
377 aa  101  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  30.81 
 
 
377 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  30.83 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  31.9 
 
 
384 aa  96.3  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  30.59 
 
 
380 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  31.49 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  31.49 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  31.49 
 
 
378 aa  94.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  30.21 
 
 
375 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  27.17 
 
 
425 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  28.03 
 
 
426 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  32.96 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  27.32 
 
 
423 aa  79  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  23.33 
 
 
360 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0813  hypothetical protein  22.95 
 
 
192 aa  48.9  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.154524  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0996  hypothetical protein  22.95 
 
 
192 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.673029  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1059  hypothetical protein  22.95 
 
 
192 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>