27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3306 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  860    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  51.72 
 
 		 467 aa  331  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  47.99 
 
 		 530 aa  322  9.000000000000001e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  45.81 
 
 		 454 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  42.4 
 
 		 452 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  37 
 
 		 430 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  41.46 
 
 		 516 aa  193  7e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  26.38 
 
 		 448 aa  170  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  27.58 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  27.06 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  27.54 
 
 		 441 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  29.21 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  32.07 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  30.9 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  30.9 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  30.9 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  29.89 
 
 		 380 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  30.5 
 
 		 377 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  29.63 
 
 		 372 aa  97.8  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  29.25 
 
 		 377 aa  96.7  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  28.51 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  29.26 
 
 		 380 aa  92  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  28.41 
 
 		 425 aa  87.8  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  25.43 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  27.71 
 
 		 423 aa  84.7  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  29.27 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  29.92 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>