27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  100 
 
 		 530 aa  1017    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  51.07 
 
 		 467 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  48.47 
 
 		 460 aa  323  7e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  40.31 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  43.42 
 
 		 454 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  37.65 
 
 		 430 aa  222  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  40.43 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  28.2 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  27.13 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  28.16 
 
 		 448 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  27.1 
 
 		 404 aa  172  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  27.75 
 
 		 458 aa  148  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  28.76 
 
 		 377 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  30.97 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  29.97 
 
 		 375 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  31.44 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  31.44 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  31.44 
 
 		 378 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  29.38 
 
 		 377 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  28.8 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  24.69 
 
 		 372 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  28.21 
 
 		 380 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  28.16 
 
 		 425 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  28.15 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  28.16 
 
 		 423 aa  57  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  39.33 
 
 		 386 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  27.14 
 
 		 360 aa  50.8  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>