27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0803 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  94.96 
 
 
377 aa  734    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  764    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  74.18 
 
 
375 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  52.7 
 
 
378 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  52.7 
 
 
378 aa  388  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  52.7 
 
 
378 aa  388  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  52.91 
 
 
380 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  50.99 
 
 
380 aa  351  1e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  44.19 
 
 
426 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  48.63 
 
 
386 aa  297  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  42.64 
 
 
425 aa  287  2e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  42.04 
 
 
423 aa  277  2e-73  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  38.8 
 
 
384 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  37.22 
 
 
372 aa  203  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  32.63 
 
 
360 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  28.47 
 
 
458 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  26.47 
 
 
441 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  27.14 
 
 
448 aa  124  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  32.53 
 
 
430 aa  123  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  27.65 
 
 
404 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  27.72 
 
 
404 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  31.42 
 
 
467 aa  106  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  29.25 
 
 
460 aa  96.7  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  31.3 
 
 
454 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  40.52 
 
 
452 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  29.38 
 
 
530 aa  79.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  34.22 
 
 
516 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>