27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0341 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0341  hypothetical protein  100 
 
 
458 aa  954    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0580  hypothetical protein  56.95 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.658008 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5092  hypothetical protein  42.69 
 
 
448 aa  346  6e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0142  hypothetical protein  42.57 
 
 
404 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5098  hypothetical protein  42.49 
 
 
404 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.332072  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1063  hypothetical protein  30.13 
 
 
452 aa  166  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3188  hypothetical protein  27.83 
 
 
467 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000405976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3306  hypothetical protein  29.21 
 
 
460 aa  146  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0364673  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33910  phosphoribosyl transferase family protein  27.08 
 
 
530 aa  146  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3669  hypothetical protein  32.65 
 
 
516 aa  144  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1348  hypothetical protein  31.27 
 
 
380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.549294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3879  hypothetical protein  28.57 
 
 
378 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.280809  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3791  hypothetical protein  28.57 
 
 
378 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0432048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0660  hypothetical protein  28.57 
 
 
378 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.230623  normal  0.188322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3012  hypothetical protein  29.78 
 
 
454 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000534501  hitchhiker  0.000212154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0935  hypothetical protein  29.18 
 
 
377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0901  hypothetical protein  29.25 
 
 
386 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3692  hypothetical protein  28.4 
 
 
380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.020193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0803  hypothetical protein  28.47 
 
 
377 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0278  hypothetical protein  29.66 
 
 
375 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.241751  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4762  hypothetical protein  27.97 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4659  hypothetical protein  27.75 
 
 
384 aa  127  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.502748  normal  0.783273 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0082  hypothetical protein  25.74 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1003  hypothetical protein  29.05 
 
 
372 aa  117  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0758  hypothetical protein  26.15 
 
 
423 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.133011 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0760  hypothetical protein  26.72 
 
 
425 aa  101  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal  0.0853528 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1268  hypothetical protein  24.2 
 
 
360 aa  82.4  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>