16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4620 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  151  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  49.28 
 
 
78 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  40.58 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  40.58 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  41.27 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  42.19 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  37.68 
 
 
73 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  41.27 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  36.23 
 
 
73 aa  62.8  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  37.68 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  37.7 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  35.48 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  40 
 
 
55 aa  57  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2785  hypothetical protein  52.5 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.253251  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  47.62 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>