35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4651 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008760  Pnap_4651  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143006  normal  0.57808 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1692  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0186807  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3485  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1934  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2087  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2160  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.639372  normal  0.128102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2363  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000393238  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2651  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2667  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.423553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2708  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52704  normal  0.80509 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2915  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000386305  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3235  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0294411  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3265  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3289  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3354  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3358  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730892  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3401  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0858405  normal  0.124182 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3413  hypothetical protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0628007  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1498  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.29415  hitchhiker  0.000395653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0007  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00000467317  normal  0.127483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0020  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0124  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0398  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0797  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0838  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0906  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.444725  normal  0.0364065 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0960  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1174  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.232233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1227  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00131975  normal  0.741688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1347  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.18568  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1388  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1465  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464265 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1496  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.279239  hitchhiker  0.000413072 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1586  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0169038 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2528  hypothetical protein  47.73 
 
 
195 aa  42.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0686848  normal  0.0541194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>