53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4653 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  100 
 
 		 359 aa  714    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  61.36 
 
 		 341 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  57.3 
 
 		 355 aa  389  1e-107  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  57.02 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  57.02 
 
 		 355 aa  390  1e-107  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  58.97 
 
 		 354 aa  384  1e-105  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  57.48 
 
 		 333 aa  369  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  57.3 
 
 		 362 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  62.24 
 
 		 341 aa  350  3e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  57.31 
 
 		 345 aa  332  7.000000000000001e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  57.31 
 
 		 345 aa  331  1e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  53.74 
 
 		 348 aa  328  6e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  47.66 
 
 		 355 aa  315  7e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  45.77 
 
 		 353 aa  314  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  47.26 
 
 		 363 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  47.19 
 
 		 360 aa  299  4e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  46.74 
 
 		 363 aa  298  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  46.63 
 
 		 360 aa  296  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  43.59 
 
 		 359 aa  288  7e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  47.98 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  49.07 
 
 		 361 aa  288  8e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  47.29 
 
 		 365 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  45.99 
 
 		 380 aa  285  7e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  46 
 
 		 364 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  44.31 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  51.05 
 
 		 364 aa  279  4e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  48.99 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  47.27 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  45.66 
 
 		 324 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  46.97 
 
 		 355 aa  272  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  46.75 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  45.29 
 
 		 325 aa  270  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  49.68 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  44.81 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  45.85 
 
 		 422 aa  262  6.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  47.04 
 
 		 319 aa  261  8.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  44.61 
 
 		 390 aa  257  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  41.98 
 
 		 350 aa  256  3e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  45.89 
 
 		 365 aa  255  8e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  47.63 
 
 		 383 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  44.59 
 
 		 374 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  44.16 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  45.32 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  39.01 
 
 		 356 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  32.46 
 
 		 309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  27.76 
 
 		 323 aa  104  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  31.84 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  32.36 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  30.06 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  35.56 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  33.03 
 
 		 255 aa  45.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1175  Integral membrane protein TerC  25.6 
 
 		 271 aa  42.7  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2770  Integral membrane protein TerC  32.22 
 
 		 255 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>