204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0110 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 161 aa  321  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0163  ribonuclease activity regulator protein RraA  93.79 
 
 		 161 aa  307  4e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0177  ribonuclease activity regulator protein RraA  93.17 
 
 		 161 aa  306  5.9999999999999995e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4795  ribonuclease activity regulator protein RraA  91.93 
 
 		 161 aa  302  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000170987 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03814  ribonuclease activity regulator protein RraA  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4056  regulator of ribonuclease activity A  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5386  ribonuclease activity regulator protein RraA  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4411  ribonuclease activity regulator protein RraA  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.081305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4371  ribonuclease activity regulator protein RraA  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520292 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03763  hypothetical protein  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4464  ribonuclease activity regulator protein RraA  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4089  ribonuclease activity regulator protein RraA  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4161  ribonuclease activity regulator protein RraA  87.58 
 
 		 161 aa  291  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4419  ribonuclease activity regulator protein RraA  86.34 
 
 		 161 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4305  ribonuclease activity regulator protein RraA  86.34 
 
 		 161 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4335  ribonuclease activity regulator protein RraA  86.34 
 
 		 161 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0948467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4489  ribonuclease activity regulator protein RraA  86.34 
 
 		 161 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4421  ribonuclease activity regulator protein RraA  86.34 
 
 		 161 aa  288  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4044  ribonuclease activity regulator protein RraA  86.34 
 
 		 161 aa  287  3e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0111  ribonuclease activity regulator protein RraA  88.82 
 
 		 161 aa  275  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.530064  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3800  ribonuclease activity regulator protein RraA  86.96 
 
 		 161 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  69.57 
 
 		 161 aa  234  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.99 
 
 		 171 aa  234  3e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0477  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.32 
 
 		 161 aa  233  8e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3549  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.32 
 
 		 161 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00109264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0407  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.32 
 
 		 161 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000143495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3723  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.32 
 
 		 161 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00679648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0508  ribonuclease activity regulator protein RraA  68.32 
 
 		 161 aa  231  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  67.7 
 
 		 161 aa  230  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  67.7 
 
 		 161 aa  230  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  67.7 
 
 		 161 aa  230  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  67.7 
 
 		 161 aa  230  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  65 
 
 		 175 aa  230  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0463  ribonuclease activity regulator protein RraA  67.08 
 
 		 161 aa  229  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  67.08 
 
 		 161 aa  227  6e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  64.38 
 
 		 169 aa  227  6e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3790  ribonuclease activity regulator protein RraA  65.84 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3370  ribonuclease activity regulator protein RraA  65.84 
 
 		 161 aa  226  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0220  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.35 
 
 		 166 aa  223  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000505209  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0530  ribonuclease activity regulator protein RraA  66.46 
 
 		 161 aa  223  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4094  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.6 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4070  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.11 
 
 		 161 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00210  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.11 
 
 		 161 aa  214  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3296  ribonuclease activity regulator protein RraA  64.6 
 
 		 170 aa  213  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0292  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.23 
 
 		 165 aa  211  2.9999999999999995e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4374  ribonuclease activity regulator protein RraA  56.88 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  57.76 
 
 		 162 aa  195  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  58.13 
 
 		 162 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  57.5 
 
 		 162 aa  190  9e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  56.25 
 
 		 162 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.06 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.06 
 
 		 163 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.06 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.28 
 
 		 162 aa  183  7e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.43 
 
 		 163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.75 
 
 		 162 aa  180  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.8 
 
 		 163 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 163 aa  157  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.68 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2071  regulator of ribonuclease activity A  44.94 
 
 		 161 aa  153  9e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1944  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.75 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000472167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.72 
 
 		 166 aa  148  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1593  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2618  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1888  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.81 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.059217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2095  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000569604  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3218  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2477  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000110984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2531  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  46.2 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1368  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2009  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.22 
 
 		 167 aa  140  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00664884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.41 
 
 		 163 aa  140  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20270  RraA family protein  48.99 
 
 		 155 aa  140  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1638  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.24 
 
 		 175 aa  140  9e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000156979  normal  0.0371486 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00936  ribonuclease activity regulator protein RraA  40.25 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2372  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.1 
 
 		 170 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  44.94 
 
 		 159 aa  137  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1292  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 165 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0683145  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1374  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.56 
 
 		 164 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000213066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1229  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.77 
 
 		 165 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000162446  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1665  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2492  regulator of ribonuclease activity A  42.76 
 
 		 170 aa  136  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2557  ribonuclease activity regulator protein RraA  37.25 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1813  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.75 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1485  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.94 
 
 		 177 aa  134  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.108799  normal  0.282904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004459  ribonuclease E inhibitor RraA  38.99 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0150677  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0114  regulator of ribonuclease activity A  46.1 
 
 		 163 aa  134  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.344528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.61 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.3 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1963  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.17 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2403  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3615  regulator of ribonuclease activity A  49.01 
 
 		 164 aa  132  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.3 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1445  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 168 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>