More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3096 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 163 aa  328  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.19 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  63.58 
 
 		 162 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  57.41 
 
 		 161 aa  205  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.96 
 
 		 162 aa  203  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.35 
 
 		 162 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.73 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.35 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  62.5 
 
 		 163 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  59.51 
 
 		 162 aa  198  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.25 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.88 
 
 		 163 aa  196  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  59.38 
 
 		 163 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  61.25 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  54.27 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1963  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.99 
 
 		 165 aa  185  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1374  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.15 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000213066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2492  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.76 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000420166  hitchhiker  0.0053907 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1382  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.15 
 
 		 170 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0465  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.21 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  55.7 
 
 		 159 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1645  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.92 
 
 		 164 aa  174  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002756  normal  0.0229312 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1593  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2531  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2618  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3218  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.76 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000162446  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2477  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000110984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1368  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2095  ribonuclease activity regulator protein RraA  53.37 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000569604  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1813  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.57 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004459  ribonuclease E inhibitor RraA  53.16 
 
 		 160 aa  171  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0150677  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  56.86 
 
 		 161 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1229  ribonuclease activity regulator protein RraA  51.59 
 
 		 165 aa  168  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1354  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.92 
 
 		 168 aa  167  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1292  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.96 
 
 		 165 aa  166  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0683145  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 175 aa  164  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  48.15 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1944  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.63 
 
 		 162 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000472167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  46.91 
 
 		 169 aa  163  8e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2557  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.96 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00936  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.37 
 
 		 160 aa  162  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  46.3 
 
 		 159 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4795  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.15 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000170987 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4363  regulator of ribonuclease activity A  49.38 
 
 		 162 aa  160  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0292  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 165 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 171 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  157  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04832  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.63 
 
 		 166 aa  157  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2622  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.93 
 
 		 161 aa  157  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1445  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.83 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2492  regulator of ribonuclease activity A  48.39 
 
 		 170 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  48.15 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1543  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000209525  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  51.47 
 
 		 136 aa  155  2e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4305  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.68 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03814  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4056  regulator of ribonuclease activity A  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03763  hypothetical protein  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4421  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.68 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4335  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.68 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0948467  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4089  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5386  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4489  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.68 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4371  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520292 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4411  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.081305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4464  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4161  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  154  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4419  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.68 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 161 aa  154  4e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.41 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0508  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.15 
 
 		 161 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2403  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.2 
 
 		 168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3549  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.53 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00109264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0407  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.53 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000143495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3723  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.53 
 
 		 161 aa  154  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00679648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0114  regulator of ribonuclease activity A  48.73 
 
 		 163 aa  153  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.344528  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4044  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.06 
 
 		 161 aa  153  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3370  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.53 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.53 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.3 
 
 		 161 aa  153  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13889  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.2 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3321  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.62 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2071  regulator of ribonuclease activity A  48.1 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2007  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.63 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.151067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2055  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.63 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.215493  hitchhiker  0.000558094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0477  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.91 
 
 		 161 aa  152  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2410  regulator of ribonuclease activity A  45.86 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.300312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1909  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.62 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.63 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.816132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0177  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.68 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0111  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.91 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.530064  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0585  regulator of ribonuclease activity A  47.47 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.444909  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0163  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.06 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>