192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1813 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1813  ribonuclease activity regulator protein RraA  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1172  ribonuclease activity regulator protein RraA  52.8 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.837665  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3096  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.77 
 
 		 163 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1223  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.08 
 
 		 164 aa  164  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.108874  normal  0.104257 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1374  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.39 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000213066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1963  ribonuclease activity regulator protein RraA  50.31 
 
 		 165 aa  160  9e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1593  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11137  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2618  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2095  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000569604  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3218  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00155848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2477  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000110984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2531  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1368  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1248  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.69 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.728506  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1992  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.78 
 
 		 165 aa  157  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000162446  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1882  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.88 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8571  predicted protein  53.68 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0694704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23290  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.25 
 
 		 162 aa  154  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41640  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.25 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3534  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.62 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1602  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.730491  hitchhiker  0.000000000811326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2092  ribonuclease activity regulator protein RraA  45 
 
 		 162 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.763155  hitchhiker  0.00360273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2060  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.47 
 
 		 163 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.163212  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2084  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 163 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.0154234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2294  dimethylmenaquinone methyltransferase family protein  45.62 
 
 		 162 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0136666  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 159 aa  149  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125864  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2492  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.85 
 
 		 164 aa  150  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000420166  hitchhiker  0.0053907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3656  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.57 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.055385  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3327  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.37 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3341  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3109  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3012  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000537886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1645  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002756  normal  0.0229312 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00721  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.25 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2551  ribonuclease activity regulator protein RraA  49.34 
 
 		 161 aa  148  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0143021  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1772  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.04 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1595  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.94 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.462955  normal  0.0410006 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3122  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.1 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3368  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.1 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3321  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.73 
 
 		 159 aa  147  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0465  ribonuclease activity regulator protein RraA  50 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2087  ribonuclease activity regulator protein RraA  45 
 
 		 162 aa  147  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.188373  normal  0.130481 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2245  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.25 
 
 		 171 aa  147  6e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0292  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.5 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1292  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.25 
 
 		 165 aa  147  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0683145  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0220  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.5 
 
 		 166 aa  147  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000505209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1229  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.25 
 
 		 165 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.698827  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001751  ribonuclease E inhibitor RraA  45.62 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00131194  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3047  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.1 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1909  ribonuclease activity regulator protein RraA  48.1 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1354  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.01 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.498794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3615  regulator of ribonuclease activity A  50.97 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2622  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.2 
 
 		 161 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1382  ribonuclease activity regulator protein RraA  47.24 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1445  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.25 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2403  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.25 
 
 		 168 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.330498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1561  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.59 
 
 		 168 aa  143  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.220477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1543  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.77 
 
 		 161 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000209525  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2727  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.84 
 
 		 163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.608878  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0386  ribonuclease activity regulator protein RraA  46.71 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3200  ribonuclease activity regulator protein RraA  44.38 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1638  regulator of ribonuclease activity A  43.48 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.626899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4795  ribonuclease activity regulator protein RraA  45 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000170987 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1955  ribonuclease activity regulator protein RraA  45.03 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8444  regulator of ribonuclease activity A  45.34 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0585  regulator of ribonuclease activity A  41.36 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.444909  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1137  regulator of ribonuclease activity A  44.1 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.75 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4106  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.75 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0110  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.75 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0177  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.12 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.607774  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2372  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.24 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.693976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0163  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3370  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.12 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4094  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4197  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2557  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.56 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4044  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.12 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0508  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2071  regulator of ribonuclease activity A  43.79 
 
 		 161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03814  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4056  regulator of ribonuclease activity A  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4161  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03763  hypothetical protein  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4371  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.520292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4464  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5386  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4411  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.081305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4089  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4421  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4305  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4335  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0948467  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4489  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3893  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.88 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0137999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0447  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.88 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.944116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0433  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.88 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0304727  hitchhiker  0.000428302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4419  ribonuclease activity regulator protein RraA  42.5 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0421  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.88 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4070  ribonuclease activity regulator protein RraA  41.25 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3800  ribonuclease activity regulator protein RraA  43.75 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>